PRJNA929647:重度IUA患者与正常对照的子宫内膜转录组谱
该数据集来自 NCBI,包含重度宫腔粘连(IUA)患者与正常对照的子宫内膜样本转录组数据。研究对 7 例重度 IUA 患者和 7 例正常对照的子宫内膜进行 RNA-seq,用于识别两组间的差异并探讨 IUA 发生机制

基本信息
资源简介
PRJNA929647:重度IUA患者与正常对照的子宫内膜转录组谱
PRJNA929647 数据集收录于 NCBI,聚焦重度宫腔粘连(IUA)患者与正常对照人群的子宫内膜转录组表达谱。宫腔粘连以子宫内膜纤维化为特征,可导致宫腔部分或完全闭塞,患者常出现闭经或月经量过少、腹痛、不孕、早期妊娠丢失或严重胎盘并发症。该研究采集重度 IUA 患者与对照的子宫内膜样本,通过 RNA-seq 比较两组转录组差异,以识别差异表达特征并探讨 IUA 的发生机制。数据集整体设计包含 7 例重度 IUA 患者(Ba)和 7 例正常对照(Con)的子宫内膜样本,主题归类为转录组或基因表达,本站分类归入妊娠、分娩和产褥期 / 其他。
【数据集背景】
宫腔粘连(Intrauterine adhesion,IUA)是一种以子宫内膜纤维化、宫腔部分或完全闭塞为特征的疾病。患者常表现为闭经或月经量过少、腹痛、不孕、早期妊娠丢失或严重胎盘并发症,对生育功能与妊娠结局造成显著影响。尽管临床上对该病的认识不断加深,但其发生发展的分子机制仍有待阐明。转录组层面的比较分析有助于从基因表达角度揭示 IUA 子宫内膜与正常子宫内膜之间的差异,为理解纤维化相关机制提供线索。该数据集正是在这一背景下,对重度 IUA 患者与正常对照的子宫内膜组织进行 RNA-seq 检测,以期识别两组之间的表达差异并探索 IUA 的发生机制。
【数据内容】
该数据集的核心内容是重度 IUA 患者与正常对照子宫内膜样本的转录组(RNA-seq)数据,主题标签为转录组或基因表达。样本分组包括 7 例重度 IUA 患者(Ba)和 7 例正常对照(Con),共计 14 例子宫内膜样本。数据可用于比较两组样本在基因表达层面的差异,进而支持差异表达分析与机制探讨。除上述样本数量、分组与数据类型外,源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),数据集英文名称为“PRJNA929647: Endometrial transcriptomic profiles in patients with severe IUA and normal control”。样本为子宫内膜样本,分别采集自重度 IUA 患者与正常对照。研究采用 RNA-seq 技术对样本进行转录组检测。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及测序平台、测序策略等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下研究方向:比较重度 IUA 与正常子宫内膜之间的转录组差异,识别差异表达基因;探讨 IUA 发生发展相关的分子机制,尤其是与子宫内膜纤维化相关的表达改变;为宫腔粘连相关的生物标志物筛选与后续验证研究提供候选表达特征;也可作为生殖医学与妊娠相关疾病研究中子宫内膜转录组对照数据的参考。需要说明的是,上述适用方向基于数据集的主题与设计,源站未提供针对具体应用场景的验证结论。
【使用方法】
使用该数据集时,可按照分组信息(7 例重度 IUA 患者与 7 例正常对照)对样本进行分组比较,开展差异表达分析,并结合转录组表达谱探讨两组间的表达模式差异。由于源站未提供具体的分析流程、参考基因组版本、标准化方法及统计阈值等信息,实际分析时需依据原始数据自行确定处理方案。若需复现或扩展研究,应以 NCBI 源站记录为准获取样本与数据信息。
【质量与限制】
该数据集的样本量为 7 例重度 IUA 患者与 7 例正常对照,属于较小规模的转录组研究,样本量限制可能影响差异分析结果的统计效力与推广性。数据集聚焦于重度 IUA 患者,结论外推至其他严重程度人群时需谨慎。关于测序深度、数据质控指标、批次效应、临床背景信息(如年龄、用药、月经周期阶段等)以及是否包含验证实验,源站未提供,因此无法对数据质量作进一步评估。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI,源站未提供具体的引用文献信息与许可条款。使用时应遵循 NCBI 源站的相关数据使用政策,并建议查阅数据集页面获取最新的引用与使用要求。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA929647
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
宫腔粘连(IUA)以子宫内膜纤维化并伴宫腔部分或完全闭塞为特征。IUA患者常出现闭经/月经过少、腹痛、不孕、早期妊娠丢失或严重胎盘并发症。本研究收集了重度IUA患者和对照患者的子宫内膜样本,进行RNA-seq以识别IUA与正常对照之间的差异,并探讨IUA发生的机制。总体设计:来自7例重度IUA患者(Ba)和7例正常对照(Con)的子宫内膜样本
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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