PRJNA1104633：早期IKKβ依赖的合成代谢与纤维化特征决定血管平滑肌细胞命运及腹主动脉瘤发展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1104633

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数据说明

腹主动脉瘤（AAA）是一种严重疾病，目前尚无有效的药物治疗。尽管炎症被认为是AAA的关键调节因素，但在疾病确立后靶向炎症通路并不能改善预后。了解最早的分子指标有助于明确AAA的精确生物学靶点和预后标志物。我们使用ApoE缺陷小鼠，在输注血管紧张素II（Ang II）和生理盐水24小时后，对肾上腹主动脉（SRA）进行了RNA-Seq。我们进一步开发了一种独特的高脂血症小鼠模型，在该模型中，核因子kappa B激酶亚基beta抑制剂（IKKβ）的表达可在血管平滑肌细胞（VSMCs）中被条件性抑制。RNA-Seq数据揭示了SRA中早期IKKβ依赖的细胞合成代谢过程，包括哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1（mTORC1）通路的激活。此外，在暴露于Ang II的小鼠中，VSMCs中Ikbkb基因的缺失显著降低了动脉瘤破裂的发生率。

原位分析进一步证实，VSMCs中IKKβ的缺失与炎症反应减轻及其收缩表型的维持相关。我们的结果强化了VSMCs在快速适应中的关键作用，这种适应导致血管壁发生有害的炎症依赖性重塑，并揭示了IKKβ在AAA发病机制中此前未被认识到的合成代谢作用。总体设计：我们使用了一种称为SMA-CreERT2IkkbFlox/FloxApoE-/-的转基因纯合小鼠模型，在该模型中，可在C57BL6背景的ApoE-/-血管SMCs中时间特异性和选择性地阻止IKKb表达（称为KO）。野生型和KO小鼠接受生理盐水或血管紧张素II（Ang II）（500至1000 ng/min/kg）皮下处理，使用渗透泵持续输注24小时。使用RNeasy Mini Kit（编号74106，Qiagen）从肾上主动脉提取总RNA。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。