PRJNA1079342：吞噬细胞 NADPH 氧化酶（NOX2）在调节小鼠中性粒细胞抗菌与炎症功能中的作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1079342

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尿路感染（UTI）是全球最常见的感染之一。尿路致病性大肠杆菌（UPEC）是尿路感染的主要病因，可引起75%的单纯性尿路感染和65%的复杂性尿路感染。固有免疫细胞在清除入侵的尿路病原体中发挥关键作用，是预防和治疗尿路感染的潜在治疗靶点。我们实验室先前的研究表明，在实验性尿路感染期间选择性清除中性粒细胞会导致感染失控，并加重膀胱和肾脏的病理损伤。然而，中性粒细胞为清除多重耐药尿路病原体（如UPEC）并解决尿路感染所采用的确切抗菌机制仍知之甚少。我们的数据集提供了关于中性粒细胞NOX2在清除UPEC以及调控这些固有免疫细胞炎症和效应功能中多方面作用的见解。我们的转录组分析显示，在UPEC刺激后，与WT中性粒细胞相比，NOX2缺陷中性粒细胞表现出更高的促炎特征。总体设计：研究NOX2在调节中性粒细胞对抗尿路致病性大肠杆菌（UPEC）功能中的作用。

我们从野生型（WT）和NOX2敲除（Cybb-/-）小鼠中采集了中性粒细胞。将分离出的中性粒细胞用UPEC或PBS（对照）刺激，随后从这些细胞中提取总RNA，进行基因表达分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。