小鼠右肾假手术与单侧肾切除后批量（24h、48h、72h）及单核（24h）水平基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1006732

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数据说明

切除一侧肾脏后，剩余肾脏能够显著增大并增强其功能的机制仍不清楚。为探索驱动代偿性肾脏肥大的通路，研究者对肾切除术后24、48和72小时发生肥大的小鼠肾脏进行了全面的RNA-seq转录研究，并与接受假手术的小鼠进行比较。结果揭示了胆固醇生物合成通路的显著时间依赖性增强、线粒体基因表达的增加以及细胞周期扰动。肾切除术后24小时的单核RNA-Seq被用于进一步探索胆固醇生物合成特征及其驱动因子SREBP2。以细胞特异性方式，snRNA-seq表明SREBP2活性在近端小管和髓质粗升支中增加，并负责IGF-1刺激后的细胞大小调节。这些结果表明SREBP2在代偿性肾脏肥大的机制中具有此前未被描述的作用。该机制可能适合通过治疗性干预来增强肾脏大小和功能。

总体设计：小鼠使用1.5-2.5%异氟烷/氧气（1.5L/min）麻醉，经腹侧中部皮肤切口进入并暴露左肾。从颅极钝性分离粘连脂肪和肾上腺。夹闭肾血供并双重结扎（Prolene 4-0）。移除夹钳，腹壁以简单间断缝合法关闭（Prolene 4-0）。皮肤以伤口夹关闭。手术时给小鼠皮下注射0.5ml 0.9%无菌生理盐水和丁丙诺啡（0.05mg/kg）。术后最初24小时内根据需要每8-12小时给予一次镇痛。假手术操作类似，但不切除肾脏。用于bulk RNA测序时，提取并定量RNA。文库制备使用Illumina TruSeq Stranded mRNA文库

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。