基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-21

资源简介

PRJDB37792：3D培养体系中牛子宫腺样结构的形成

PRJDB37792 数据集围绕牛子宫腺在三维（3D）培养体系中的形态变化展开，通过 RNA-seq 分析比较了在添加或不添加生长因子（GFs）与细胞外基质（ECMs）条件下培养的牛子宫腺样本的 mRNA 表达水平。该数据集的主题标签为转录组或基因表达，归属于泌尿生殖系统疾病/其他分类，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。其核心价值在于为理解 GFs 与 ECMs 如何影响 3D 培养牛子宫腺的形态改变提供基因表达层面的观察数据，可供相关基础研究与培养体系优化参考。

【数据集背景】

牛子宫腺是子宫内的重要结构，其形态发生与功能维持受到微环境中多种因素的调控。在体外研究中，三维培养体系被用于模拟更接近体内的组织环境，而生长因子与细胞外基质是其中两类关键的环境因素。该数据集对应的研究正是基于这一背景，关注 GFs 与 ECMs 对 3D 培养牛子宫腺形态变化的影响，并通过转录组层面的 mRNA 表达分析来观察不同培养条件下的基因表达差异。该数据集被归入泌尿生殖系统疾病/其他分类，说明其与泌尿生殖系统相关研究存在关联，但其具体研究内容聚焦于牛子宫腺的体外培养与基因表达分析。

【数据内容】

该数据集的内容为 RNA-seq 分析所得的 mRNA 表达水平数据。样本来自 3D 培养的牛子宫腺，实验条件涉及生长因子的存在与缺失，以及细胞外基质的存在与缺失。通过比较这些条件下样本的 mRNA 表达水平，数据集记录了不同培养环境对基因表达的影响。主题标签为转录组或基因表达，表明数据主体属于基因表达层面的转录组数据。除上述信息外，样本数量、测序深度、表达矩阵的具体格式、基因注释版本等细节源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。研究采用 RNA-seq 分析方法，对从 3D 培养的牛子宫腺中提取的 RNA 样本进行表达水平检测。实验设计围绕生长因子与细胞外基质的有无设置培养条件，以观察这些因素对牛子宫腺形态变化相关基因表达的影响。该数据集的英文名称为 PRJDB37792: Formation of bovine uterine gland-like structures in 3D culture systems。关于样本采集的具体时间、地点、动物个体信息、RNA 提取与建库的具体流程等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是涉及牛子宫腺体外三维培养、生长因子与细胞外基质作用机制探索的基础研究。研究人员可将其用于比较不同培养条件下 mRNA 表达差异，辅助理解 GFs 与 ECMs 对子宫腺形态变化的潜在影响。由于该数据集归入泌尿生殖系统疾病/其他分类，也可作为泌尿生殖系统相关组织培养研究的参考数据。需要强调的是，该数据集的具体应用应以其转录组数据属性为基础，不宜超出源站描述所界定的研究范围。

【使用方法】

使用该数据集时，可围绕生长因子与细胞外基质的有无这一实验设计，对 RNA-seq 所得的 mRNA 表达水平进行比较分析。由于数据主题为转录组或基因表达，常规使用方式包括差异表达分析、表达模式比较等。具体的数据下载方式、文件格式、分析流程与参数设置，源站未提供，使用前应依据源站的实际数据组织方式进行确认。对于样本分组、重复设置等影响分析的因素，源站未提供，需在使用时加以核实。

【质量与限制】

该数据集基于 RNA-seq 分析，数据内容为 mRNA 表达水平，研究目的明确指向 GFs 与 ECMs 对 3D 培养牛子宫腺形态变化的影响。其限制在于：源站描述未提供样本量、测序质量指标、重复数、统计分析方法及验证实验等信息，因此无法据此评估数据的统计稳健性与可重复性。此外，数据仅涉及牛子宫腺的体外 3D 培养体系，向其他物种、其他组织或体内情境的外推需谨慎。关于数据质量控制的具体措施，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJDB37792: Formation of bovine uterine gland-like structures in 3D culture systems。关于引用方式、许可条款、使用限制及数据访问权限等具体信息，源站未提供，使用者在引用与再利用前应查阅源站的相关说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB37792

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB37792

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们通过RNA-seq分析检测了mRNA表达水平，所用RNA样本提取自在有无生长因子（GFs）和细胞外基质（ECMs）条件下三维培养的牛子宫腺体。本研究旨在了解GFs和ECMs对三维培养牛子宫腺体形态变化的影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别