Sbno1点突变小鼠基因表达谱数据集
该数据集来自 NCBI，包含对携带 SBNO1 点突变（对应自闭症患者变异，第996位丝氨酸变为脯氨酸）的新生突变小鼠大脑皮层进行的 RNA-seq 基因表达谱分析，并以 Sbno1 flox/flox 小鼠作为对照
基本信息
资源简介
Sbno1点突变小鼠基因表达谱数据集
PRJDB37498 是一个聚焦小鼠基因表达谱的转录组数据集，全称为 Gene expression profiling of Sbno1 point mutant mice。该数据集围绕 SBNO1 基因点突变展开：研究者构建了携带该点突变的小鼠模型，该突变对应在自闭症患者中识别到的变异，导致第 996 位氨基酸由丝氨酸变为脯氨酸。此类小鼠同时表现出形态学和行为学方面的异常。为分析突变对基因表达的影响，研究者采集新生突变小鼠的大脑皮层组织进行 RNA-seq，并以 Sbno1 flox/flox 小鼠作为对照，从而获得突变组与对照组大脑皮层的基因表达谱数据。数据集以转录组或基因表达为主题标签，在站内归入妊娠、分娩和产褥期／其他分类，来源为 NCBI。
【数据集背景】
该数据集的研究背景建立在 SBNO1 基因点突变与自闭症相关变异的对应关系之上。研究者生成了一种携带 SBNO1 点突变的小鼠模型，该点突变对应在自闭症患者中发现的变异，具体表现为第 996 位残基由丝氨酸替换为脯氨酸。携带该突变的小鼠表现出形态学和行为学两方面的异常，提示该突变具有可观察的表型效应。为了在分子层面理解这一突变的后果，研究者选择新生小鼠的大脑皮层作为研究对象，通过 RNA-seq 分析基因表达变化，并以 Sbno1 flox/flox 小鼠作为对照，形成突变组与对照组的比较设计。
【数据内容】
数据集的核心内容是基因表达谱数据，即对新生突变小鼠大脑皮层进行 RNA-seq 所获得的转录组测量结果，同时包含以 Sbno1 flox/flox 小鼠为对照的表达谱数据。主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明数据属于转录组或基因表达范畴。数据可用于比较携带 SBNO1 点突变的样本与对照样本之间的大脑皮层基因表达差异。关于样本数量、测序深度、 reads 长度、表达定量矩阵的具体格式与文件组成，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。样本采集对象为新生突变小鼠的大脑皮层，对照样本为 Sbno1 flox/flox 小鼠。实验方法为 RNA-seq，用于分析基因表达。关于具体的建库策略、测序平台、测序试剂与数据处理流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 SBNO1 点突变对新生小鼠大脑皮层基因表达的影响，可用于突变组与对照组之间的差异表达分析，也可为探讨该突变对应自闭症相关变异的下游分子机制提供转录组层面的参考。此外，携带该突变小鼠所表现出的形态学与行为学异常，使该表达谱数据可作为连接基因型、表达变化与表型之间的分析素材。关于该数据集在其他疾病领域或人群研究中的直接适用性，源站未提供。
【使用方法】
使用时可将突变小鼠大脑皮层的 RNA-seq 表达谱与 Sbno1 flox/flox 对照小鼠的表达谱进行对比，识别差异表达基因并开展功能层面的分析。由于数据集主题为转录组或基因表达，分析应以表达定量与比较为主线。关于数据下载方式、文件命名规则、预处理步骤与推荐分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于小鼠模型，研究对象为新生小鼠大脑皮层，样本组织与发育阶段具有特定性，结论外推到其他组织、其他发育阶段或人类时需谨慎。对照为 Sbno1 flox/flox 小鼠，比较设计围绕该对照展开，关于批次效应、重复数、测序质量指标与数据完整性评估，源站未提供。
【引用与许可】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集标识为 PRJDB37498。关于引用方式、许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB37498
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们构建了一种携带SBNO1点突变的小鼠模型，该突变对应于一名自闭症患者中发现的变异。这些小鼠表现出形态学和行为学异常。该突变导致第996位丝氨酸被脯氨酸取代。我们采集了新生突变小鼠的大脑皮层，并进行了RNA-seq以分析基因表达。作为对照，我们使用了Sbno1 flox/flox小鼠。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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