CAKUT胎儿羊水样本肽谱数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.10497903

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.3 MB。

数据说明

摘要 先天性肾脏和尿路畸形（CAKUT）是儿童终末期肾病的首要病因，也是成人慢性肾病的重要病因。遗传和环境因素已被证实会影响CAKUT的发生发展，但已知的疾病机制仍不完整。我们的目标是通过多组学分析（包括肽组学）来识别CAKUT中受影响的通路和网络。本文发布的肽组数据对应于先前发表的出生后肾脏存活数据集[pmid：32750455]的原始数据。miRNome和蛋白质组[pmid：33987838]数据分别可在另一个存储库和PRIDE中获取。研究设计 在一项聚焦胎儿双侧CAKUT的前瞻性多中心观察性研究（临床试验的一部分）中收集了羊水样本。此外，还从21名非CAKUT个体中收集了样本。严重程度根据出生后随访2年后的肾脏状况进行定义。使用羊水提取肽段进行LC-MS/MS和CE-MS/MS分析。完整方案见补充材料。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。