PALOH-UK:即时MT-RNR1检测实施后抗生素给药时间的贝叶斯分析数据与代码

该存储库包含PALOH-UK研究中抗生素给药时间贝叶斯分层分析的去标识化汇总数据、Python分析代码及配套文档。PALOH-UK是一项前瞻性、多中心实施研究,评估于2025年3月至2026年6月期间在英格兰、苏格兰、威尔士和北爱尔兰的14个新生儿病房将快速即时MT-RNR1基因分型引入常规新生儿护

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2026-10-21 更新
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基因组回归新生儿护理MT-RNR1基因分型即时检测贝叶斯分层分析抗生素给药时间实施研究药物基因组学
PALOH-UK: Data and code for Bayesian analysis of time to antibiotic administration following implementation of point-of-care MT-RNR1 testing

基本信息

模态
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许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

PALOH-UK:即时MT-RNR1检测实施后抗生素给药时间的贝叶斯分析数据与代码

该存储库包含PALOH-UK研究中抗生素给药时间贝叶斯分层分析的去标识化汇总数据、Python分析代码及配套文档。PALOH-UK是一项前瞻性、多中心实施研究,评估于2025年3月至2026年6月期间在英格兰、苏格兰、威尔士和北爱尔兰的14个新生儿病房将快速即时MT-RNR1基因分型引入常规新生儿护

PALOH-UK: Data and code for Bayesian analysis of time to antibiotic administration following implementation of point-of-care MT-RNR1 testing

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该存储库包含PALOH-UK研究中抗生素给药时间贝叶斯分层分析的去标识化汇总数据、Python分析代码及配套文档。PALOH-UK是一项前瞻性、多中心实施研究,评估于2025年3月至2026年6月期间在英格兰、苏格兰、威尔士和北爱尔兰的14个新生儿病房将快速即时MT-RNR1基因分型引入常规新生儿护理的情况。该研究评估将药物遗传学检测纳入新生儿入院路径是否影响抗生素的及时给药。该存储库提供用于估计实施后抗生素给药时间变化的数据和代码,并考虑了新生儿病房之间的差异、基线测量的不确定性以及实施后的重复审计。主要分析

【主题与分类】

主题标签:新生儿护理、MT-RNR1基因分型、即时检测、贝叶斯分层分析、抗生素给药时间、实施研究、药物基因组学。本站分类:妊娠、分娩和产褥期。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23547731

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本仓库包含PALOH-UK研究中抗生素给药时间贝叶斯分层分析的匿名汇总数据、Python分析代码及配套文档。PALOH-UK是一项前瞻性、多中心实施研究,评估于2025年3月至2026年6月期间在英格兰、苏格兰、威尔士和北爱尔兰的14个新生儿病房将快速床旁MT-RNR1基因分型引入常规新生儿护理的效果。该研究评估了将药物基因组学检测纳入新生儿入院流程是否影响抗生素的及时给药。本仓库提供了用于估计实施后抗生素给药时间变化的数据和代码,分析中考虑了新生儿病房之间的差异、基线测量中的不确定性以及实施后反复审计的情况。主要分析纳入863例抗生素给药时间大于零且不超过120分钟的入院病例。敏感性分析将上限阈值延长至180分钟(948例入院病例),并完全取消上限阈值(990例入院病例)。

该存储库包含分析脚本、输入数据集、模型设定、可复现性说明,以及主分析和敏感性分析的输出结果,包括收敛诊断。相关手稿:McDermott JH等。全国实施床旁MT-RNR1检测以预防新生儿氨基糖苷类诱导的耳毒性:一项前瞻性多中心研究。研究注册号:ISRCTN10216938。资助:美国国家卫生与照护研究所(NIHR)创新发明(i4i)计划(NIHR208090)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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