免疫分析与蛋白质组学数据集:尿液CXCL-9作为急性间质性肾炎诊断生物标志物的鉴定与验证
该数据集来自search.dataone.org,聚焦急性间质性肾炎(AIN)的诊断生物标志物研究。数据覆盖基于适配体的免疫分析检测的180种免疫蛋白、尿液CXCL-9的夹心免疫分析验证、两个活检确诊验证队列以及肾脏组织中mRNA表达差异分析

基本信息
资源简介
免疫分析与蛋白质组学数据集:尿液CXCL-9作为急性间质性肾炎诊断生物标志物的鉴定与验证
Immunoassay and proteomics dataset: Identification and validation of urine CXCL-9 as a biomarker for diagnosis of acute interstitial nephritis
该数据集来自search.dataone.org,聚焦急性间质性肾炎(AIN)的诊断生物标志物研究。数据覆盖基于适配体的免疫分析检测的180种免疫蛋白、尿液CXCL-9的夹心免疫分析验证、两个活检确诊验证队列以及肾脏组织中mRNA表达差异分析。可用于探索免疫蛋白与AIN的关联、验证CXCL-9作为无创诊断标志物的潜力,并支持肾小管间质疾病相关的蛋白质组学与病理学研究(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:急性肾小管间质性肾炎(AIN)是少数具有诊断特异性治疗选择的急性肾损伤病因之一。然而,由于需要获取肾脏活检进行组织学确认,AIN的诊断可能被延迟、遗漏或错误假设。在此,我们鉴定并验证尿液CXCL-9——一种参与淋巴细胞趋化的干扰素-γ诱导趋化因子——作为AIN的诊断生物标志物。方法:在一个前瞻性入组且经病理学家裁定组织学诊断的队列(发现队列)中,我们测试了通过基于适配体的检测方法测量的180种免疫蛋白与AIN的关联,并使用夹心免疫分析验证了最佳蛋白CXCL-9。我们在2个经活检确认诊断的队列(验证队列)中外部验证了这些发现,并检查了AIN患者肾脏组织中的mRNA表达差异。
【主题与分类】
主题标签:Histopathology、General Medicine、Nephrology、Proteomics、Tubulointerstitial disease、Biomarkers、Nephritis。本站分类:泌尿生殖系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Aef68d75951ea301dd27bc01288342d70aad06fde16bca52afa4bf9f382142cc8
使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
背景:急性肾小管间质性肾炎(AIN)是少数具有诊断特异性治疗方案的急性肾损伤病因之一。然而,由于需要获取肾脏活检以进行组织学确认,AIN的诊断可能被延迟、遗漏或错误推断。在此,我们识别并验证尿液CXCL-9——一种干扰素-γ诱导的、参与淋巴细胞趋化的趋化因子——作为AIN的诊断生物标志物。方法:在一个前瞻性入组、经病理学家裁定组织学诊断的队列(发现队列)中,我们检测了通过基于适配体的测定法测量的180种免疫蛋白与AIN的关联,并使用夹心免疫测定法验证了排名最高的蛋白CXCL-9。我们在2个经活检确认诊断的队列(验证队列)中对外部验证了这些发现,并检查了AIN患者与对照者肾组织中mRNA表达的差异。
结果:在基于适配体的检测中,AIN患者尿液CXCL-9水平比对照组高7.6倍(P…,,,免疫测定与蛋白质组学数据集:尿液CXCL-9作为急性间质性肾炎诊断生物标志物的鉴定与验证 10.5061/dryad.ksn02v788 ## 数据与文件结构说明 来自耶鲁AIN研究的横断面数据,包括在两个医疗中心接受肾活检的参与者 观测值:249 变量:26 2020年10月13日 13:42 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 变量存储显示值 名称 类型 格式 标签 变量标签 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sequenceno str17 %17s sequenceno diagnosis_histo byte %22.0g diagnosis1_ Diagnosis1 ain_prebx byte %8.0g ain_prebx_ 活检前是否怀疑AIN? ain_…
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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