大鼠3天禁水后全肾转录组数据集
该数据集为大鼠在3天禁水后的全肾转录组测序数据,包含自由饮水与禁水两种条件下的肾脏基因表达谱。通过高通量测序全面观察肾脏基因表达变化,可用于识别与脱水反应相关的差异表达基因,并与其他全肾转录组数据集比较,寻找保守的基因表达响应(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
大鼠3天禁水后全肾转录组数据集
GSE242702 数据集收录了大鼠在连续3天禁水处理后的全肾转录组测序数据,涵盖自由饮水与禁水两种条件下的肾脏基因表达谱。该数据由 NCBI 来源站发布,旨在通过高通量测序全面观察肾脏在水分摄入减少时的基因表达变化,识别与脱水反应相关的差异表达基因,并支持与其他全肾转录组数据集比较以寻找保守的基因表达响应。数据集属于泌尿生殖系统疾病/其他分类,包含1个文件,即 GSE242702_series_matrix.txt.gz,作者为 Benjamin T. Gillard,发布时间为 Sep 08 202。
【数据集背景】
该数据集的建立源于对肾脏在机体水分摄入减少时基因表达响应的研究需求。研究目的是寻找当机体水分摄入减少时肾脏中差异表达的基因。实验设计中,动物要么可以自由饮水,要么连续3天不饮水,随后对全肾进行测序,以获得肾脏基因表达的全面视图。差异表达基因可能参与肾脏对脱水的响应。该数据集可用于与其他全肾转录组数据集比较,以发现保守的基因表达响应。
【数据内容】
数据集内容为大鼠全肾转录组测序数据,包含自由饮水与禁水两种条件下的肾脏基因表达谱。数据文件数量为1个,文件样例为 GSE242702_series_matrix.txt.gz。主题标签包括 Expression profiling by high sequencing、GPL20084 和 10116。数据集英文名称为 GSE242702: Whole kidney transcriptome of the rat after 3 days water restriction,源站标题为 Whole kidney transcriptome of the rat after 3 days water restriction。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。作者为 Benjamin T. Gillard。发布时间为 Sep 08 202。源站描述说明,该研究对全肾进行测序,以全面了解肾脏基因表达;差异表达基因可能参与肾脏对脱水的响应。数据集本站分类为泌尿生殖系统疾病/其他。
【适用场景】
该数据集适用于识别与脱水反应相关的差异表达基因,并可用于与其他全肾转录组数据集比较,寻找保守的基因表达响应。其研究场景涉及机体水分摄入减少条件下肾脏基因表达变化的观察,属于表达谱分析范畴,采用高通量测序技术。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE242702_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。
【质量与限制】
源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242702
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在寻找机体水摄入减少时肾脏中差异表达的基因。动物或可自由饮水,或禁水3天。对全肾进行测序,以全面了解肾脏基因表达情况。差异表达的基因可能参与肾脏对脱水的反应。该数据集可用于与其他全肾转录组数据集进行比较,以发现保守的基因表达反应。
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