绵羊宫颈组织跨品种RNASEQ分析数据集
该数据集为绵羊宫颈组织的跨品种RNASEQ分析数据，旨在利用冷冻-解冻精液进行宫颈人工授精后妊娠率已知存在差异的四个欧洲母羊品种，刻画其宫颈转录组特征
基本信息
资源简介
绵羊宫颈组织跨品种RNASEQ分析数据集
GSE179486 是一个聚焦绵羊宫颈组织转录组的跨品种 RNA 测序数据集，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），标题为“Cross breed RNASEQ analysis of cervical tissues in sheep”。该数据集围绕四个欧洲母羊品种展开，这些品种在接受冷冻-解冻精液宫颈人工授精后的妊娠率存在已知差异，研究目的在于刻画其宫颈转录组特征。数据集由 Paul、Cormican 提交，发布时间为 2020 年 7 月 5 日，在本站归入“妊娠、分娩和产褥期 / 其他”分类，主题涉及高通量测序表达谱分析，关联平台 GPL27721 与物种编号 9940，共包含 1 个数据文件。
【数据集背景】
宫颈在绵羊繁殖过程中承担重要功能，而不同品种母羊在接受宫颈人工授精后的妊娠率存在差异，这种差异背后的分子机制值得从转录组层面加以探索。该数据集正是针对这一背景设计，选取四个欧洲母羊品种作为研究对象，这些品种在接受冷冻-解冻精液宫颈人工授精后的妊娠率已知存在差别。研究以宫颈组织为材料开展 RNA 测序，试图通过跨品种比较揭示与妊娠率差异相关的宫颈转录组特征，为理解绵羊宫颈功能与繁殖性能之间的关系提供表达谱层面的数据基础。
【数据内容】
数据集的核心内容是绵羊宫颈组织的跨品种 RNA 测序表达谱数据，主题标签表明其属于“Expression profiling by high throughput sequencing”，即基于高通量测序的表达谱分析。数据以系列矩阵文件形式提供，文件样例为 GSE179486_series_matrix.txt.gz，整个数据集仅包含这 1 个文件。该文件通常承载样本层面的表达信息与相关注释，可用于查看各样本的表达数值及分组信息。数据涉及四个欧洲母羊品种的宫颈组织样本，具体样本数量、测序深度、基因注释版本等细节源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI 站点，源站标题与数据集英文名一致，均为“Cross breed RNASEQ analysis of cervical tissues in sheep”。源站描述说明，研究目的是利用冷冻-解冻精液进行宫颈人工授精后妊娠率已知存在差异的四个欧洲母羊品种，刻画其宫颈转录组特征。数据由 Paul、Cormican 提交，发布时间为 2020 年 7 月 5 日。关联的测序平台标识为 GPL27721，物种标识为 9940（绵羊）。关于样本采集的具体时间、地点、动物饲养条件及伦理审批等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于绵羊繁殖生理与宫颈功能相关的转录组研究，尤其是围绕不同品种间妊娠率差异的分子机制探索。研究者可将其用于跨品种宫颈基因表达的比较分析，寻找与高、低妊娠率相关的表达特征；也可作为绵羊宫颈组织表达谱的参考数据，用于候选基因筛选、通路富集分析或与其他绵羊繁殖组织转录组数据的整合研究。此外，对于从事人工授精技术优化、冷冻-解冻精液利用效率提升等应用方向的研究人员，该数据亦具有参考价值。需要说明的是，具体分析结论须以实际数据为准，源站未提供既定的分析结果。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE179486_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩格式，需先解压再按文本矩阵格式读取。建议先在小样本上核对字段名称、样本分组与编码方式，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅含一个系列矩阵文件，分析前应结合平台 GPL27721 的注释信息完成探针或基因标识的映射。若需原始测序读数，源站未提供相关文件说明，应以现有矩阵文件为准开展分析。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，且为系列矩阵形式，未提供原始测序数据文件，可能限制对测序质量、比对率等原始指标的核查。样本量、重复数、测序深度、差异表达分析结果等关键信息源站未提供，使用时应谨慎评估统计效力。此外，数据仅覆盖四个欧洲母羊品种的宫颈组织，结论外推到其他品种、其他组织或其他授精条件时需保持审慎。关于数据是否存在批次效应、是否经过标准化处理等，源站未提供说明。
【引用与许可】
数据来自 NCBI，提交者为 Paul、Cormican，发布时间为 2020 年 7 月 5 日。使用时应遵循 NCBI 及原数据提交方的相关要求，具体引用格式、许可条款与使用限制源站未提供，建议使用者访问源站页面查阅最新说明并规范引用。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE179486
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Aim to characterize the cervical transcriptome of four European ewe breeds with known differences in pregnancy rates following cervical AI using frozen-thawed semen.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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