cBioPortal Datahub SU2C 2019下载数据

GitHub Datahub提供SU2C/PCF 2019 mCRPC队列的可下载临床、表达、突变和拷贝数文件,适合复现和批量建模。

cBioPortalcBioPortal
GitHub
2025-01-01 更新
浏览 47
多模态分类
cBioPortal Datahub prad_su2c_2019

基本信息

模态
多模态
大小
1.16 GB
数据量
444
任务类型
分类
创建/更新时间
2025-01-01
版本
master

资源简介

cBioPortal Datahub SU2C 2019下载数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《cBioPortal/datahub》。源站首次发布:2016-07-14。

【数据内容】

源站原始描述:A centralized location for storing curated data from cBioPortal # cBioPortal Public Datahub The datahub is a repository for data storage only. It contains staging files which are validated and can be loaded directly into the cBioPortal. Behind the scenes Git LFS is used to manage large files. The backend LFS storage is provided by ## Test Status Validation status of all studies on Datahub master branch. This runs weekly using the validation code from the cBioPortal master branch. It also validat…

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://github.com/cBioPortal/datahub

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-08-28,引用时请注意版本时效。

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下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

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无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

git clone https://github.com/cBioPortal/datahub.git

curl -L -o repo.zip https://github.com/cBioPortal/datahub/archive/refs/heads/master.zip
unzip repo.zip

源站 README 摘录(使用方式)

How to Download Data

Downloading zip files individual studies

At cbioportal.org datasets page a zipped file with staging files from each study can be downloaded. These zip files are compressed versions of the study folders in the master branch of this repository.

Example downloading individual study with git-lfs

It is also possible to download uncompressed staging files from this repository with git-lfs.

After you have installed git-lfs, configure it not to download all data files right away:

git lfs install skip-repo skip-smudge

Clone the git repository and install lfs hooks into it:

git clone https://github.com/cBioPortal/datahub.git
cd datahub
git lfs install local skip-smudge

Download the data files for a study folder, for example brca_tcga:

git -c lfs.fetchexclude="" lfs pull -I public/brca_tcga

Note: The -c lfs.fetchexclude="" override is required because this repository’'s .lfsconfig excludes all LFS downloads by default to prevent accidentally pulling all large files on clone. Without it, the -I flag will be ignored and only LFS pointers will be downloaded.

完整仓库:github.com/cBioPortal/datahub

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