尿道下裂患者来源人包皮成纤维细胞中低剂量双酚A新靶点的鉴定

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Identification of Novel Low-Dose Bisphenol A Targets in Human Foreskin Fibroblast Cells Derived from Hypospadias Patients
• DOI：10.1371/journal.pone.0036711
• 发布日期：2012-05-04
• 文件数：6 个
• 文件总体积：3.24 MB
• 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_Novel_Low_Dose_Bisphenol_A_Targets_in_Human_Foreskin_Fibroblast_Cells_Derived_from_Hypospadias_Patients/125464

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文件清单

• Figure_S1.docx（264.87 KB）
• Figure_S2.docx（1.02 MB）
• Figure_S3.docx（1.25 MB）
• Figure_S4.docx（602.34 KB）
• Table_S1.docx（97.43 KB）
• Table_S2.docx（17.42 KB）

文件总体积 3.24 MB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

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import glob, os

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       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
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# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景/目的
低剂量双酚A（BPA）暴露对人类生殖健康的影响仍存在争议。为更好地理解BPA对人类生殖健康影响的分子基础，利用来源于儿童尿道下裂（HS）患者的人包皮成纤维细胞（hFFCs）进行全基因组筛选，以识别低剂量BPA暴露的新靶点。方法/主要发现
在暴露于10 nM BPA、0.01 nM 17β-雌二醇（E2）或1 nM 2,3,7,8-四氯二苯并-p-二噁英（TCDD）24小时后，测量hFFCs的基因表达谱。使用非配对Student’s t检验鉴定差异表达基因，P值截断值为0.05，倍数变化大于1.2。这些基因被选用于使用Ingenuity Pathways Analysis、Pathway Express和KegArray进行网络生成和通路分析。鉴定出71个基因（42个下调和29个上调）在响应BPA时显著差异表达，其中与E2和TCDD相比，发现43个基因仅受BPA影响。

特别值得注意的是，实时PCR分析显示，基质金属肽酶11（MMP11）——一种已知在发育和正常生理过程中发挥效应的因子——其表达被发现受到BPA的抑制（在10 nM和100 nM浓度下分别降低至0.47倍和0.37倍）。此外，对来源于HS和隐睾症（CO）患者的hFFCs（分别为n=23和11）进行的研究表明，HS组的MMP11表达显著低于CO组（0.25倍，P=0.0027）。结论/意义

本研究表明，BPA参与HS病因学可能与其下调MMP11有关。进一步研究以阐明本研究中鉴定的新型靶基因在生殖结节发育过程中的功能，可能会增进我们对低剂量BPA暴露对人类生殖健康影响的认识。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0036711（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_Novel_Low_Dose_Bisphenol_A_Targets_in_Human_Foreskin_Fibroblast_Cells_Derived_from_Hypospadias_Patients/125464）。