大鼠正畸性牙根吸收压力侧牙周组织转录组图谱

该数据集来自 NCBI GEO(GSE347094),对大鼠正畸性牙根吸收(OIRR)模型与对照上颌第一磨牙周围压力侧牙周组织进行 RNA 测序,包含 1 个 series matrix 文件

geo
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基因组分类GPL2594710116
GSE347094: Transcriptome profiling of compression-side periodontal tissues from rats with orthodontically induced root resorption

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

大鼠正畸性牙根吸收压力侧牙周组织转录组图谱

Transcriptome profiling of compression-side periodontal tissues from rats with orthodontically induced root resorption

该数据集来自 NCBI GEO(GSE347094),对大鼠正畸性牙根吸收(OIRR)模型与对照上颌第一磨牙周围压力侧牙周组织进行 RNA 测序,包含 1 个 series matrix 文件。数据覆盖转录组表达谱及差异表达基因与通路富集分析结果,涉及铁死亡相关通路、花生四烯酸代谢、谷胱甘肽代谢、炎症反应和破骨细胞分化等生物学过程,可用于探究正畸力致牙周组织损伤的分子机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):正畸性牙根吸收(OIRR)是正畸治疗的常见并发症,但过度正畸力导致牙周组织损伤的分子机制仍不完全清楚。本研究对对照与 OIRR 大鼠模型上颌第一磨牙周围压力侧牙周组织进行 RNA 测序,以表征转录组改变。通过差异表达基因与通路富集分析,识别与正畸力诱导组织损伤相关的生物学过程。转录组分析显示,铁死亡相关通路、花生四烯酸代谢、谷胱甘肽代谢、炎症反应及破骨细胞分化发生显著改变。这些数据为研究 OI 相关分子机制提供了全面资源。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL25947、10116。本站分类:口腔疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347094

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 04 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

正畸诱导的牙根吸收(OIRR)是正畸治疗的常见并发症,但过度正畸力导致牙周组织损伤的分子机制仍不完全清楚。本研究采用RNA测序技术,对对照组和OIRR大鼠模型上颌第一磨牙周围受压侧牙周组织的转录组改变进行了表征。通过差异表达基因和通路富集分析,识别与正畸力诱导的组织损伤相关的生物学过程。转录组分析揭示了铁死亡相关通路、花生四烯酸代谢、谷胱甘肽代谢、炎症反应及破骨细胞分化等方面的显著改变。这些数据为研究OIRR发生和发展的分子机制提供了全面的资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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