Ncr1_HIF1_GAS
该数据集为RNA测序（RNAseq）生成的基因表达谱数据，包含小鼠皮肤伤口感染A组链球菌后第2天的样本，涉及野生型和条件性基因修饰小鼠的皮肤损伤与伤口组织；数据模态为转录组学基因表达数据，主要用于研究皮肤感染免疫机制、HIF-1α基因功能以及伤口愈合过程中的分子调控网络。
基本信息
资源简介
Ncr1_HIF1_GAS
【数据集背景】
源站首次发布：2021-06-15。
【数据内容】
源站原始描述：RNAseq analysis for the gene expression profile of three skin lesions of Ncr1Cre-/HIF-1α+f/+f (WT; H_G_S_W1, H_G_S_W2, H_G_S_W3) mice and of three skin wounds of Ncr1Cre + /HIF-1α+f/+f (H_G_S_K1, H_G_S_K2, H_G_S_K3) mice mice at day 2 post infection with group A Streptococcus
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 5.56 MB。数据集 DOI：10.17632/7nk8j9h6yp.1。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/7nk8j9h6yp
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/7nk8j9h6yp
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含通过RNA测序（RNAseq）技术获取的基因表达谱数据，主要研究小鼠皮肤伤口感染A组链球菌后的免疫反应。数据集包括两组小鼠样本：一组为Ncr1Cre-/HIF-1α+f/+f（野生型）小鼠的三个皮肤损伤样本（H_G_S_W1, H_G_S_W2, H_G_S_W3），另一组为Ncr1Cre+/HIF-1α+f/+f（条件性基因修饰）小鼠的三个皮肤伤口样本（H_G_S_K1, H_G_S_K2, H_G_S_K3），所有样本均在感染后第2天采集。数据来源于实验模型构建，适用于皮肤感染免疫机制、转录组学分析以及HIF-1α基因在伤口愈合中的作用等研究方向。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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