Ncr1_HIF1_GAS
该数据集为RNA测序(RNAseq)生成的基因表达谱数据,包含小鼠皮肤伤口感染A组链球菌后第2天的样本,涉及野生型和条件性基因修饰小鼠的皮肤损伤与伤口组织;数据模态为转录组学基因表达数据,主要用于研究皮肤感染免疫机制、HIF-1α基因功能以及伤口愈合过程中的分子调控网络。
基本信息
资源简介
该数据集包含通过RNA测序(RNAseq)技术获取的基因表达谱数据,主要研究小鼠皮肤伤口感染A组链球菌后的免疫反应。数据集包括两组小鼠样本:一组为Ncr1Cre-/HIF-1α+f/+f(野生型)小鼠的三个皮肤损伤样本(H_G_S_W1, H_G_S_W2, H_G_S_W3),另一组为Ncr1Cre+/HIF-1α+f/+f(条件性基因修饰)小鼠的三个皮肤伤口样本(H_G_S_K1, H_G_S_K2, H_G_S_K3),所有样本均在感染后第2天采集。数据来源于实验模型构建,适用于皮肤感染免疫机制、转录组学分析以及HIF-1α基因在伤口愈合中的作用等研究方向。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务,注意,服务不针对数据相关产权,只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/7nk8j9h6yp
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含通过RNA测序(RNAseq)技术获取的基因表达谱数据,主要研究小鼠皮肤伤口感染A组链球菌后的免疫反应。数据集包括两组小鼠样本:一组为Ncr1Cre-/HIF-1α+f/+f(野生型)小鼠的三个皮肤损伤样本(H_G_S_W1, H_G_S_W2, H_G_S_W3),另一组为Ncr1Cre+/HIF-1α+f/+f(条件性基因修饰)小鼠的三个皮肤伤口样本(H_G_S_K1, H_G_S_K2, H_G_S_K3),所有样本均在感染后第2天采集。数据来源于实验模型构建,适用于皮肤感染免疫机制、转录组学分析以及HIF-1α基因在伤口愈合中的作用等研究方向。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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