Ncr1_HIF1_GAS

该数据集为RNA测序(RNAseq)生成的基因表达谱数据,包含小鼠皮肤伤口感染A组链球菌后第2天的样本,涉及野生型和条件性基因修饰小鼠的皮肤损伤与伤口组织;数据模态为转录组学基因表达数据,主要用于研究皮肤感染免疫机制、HIF-1α基因功能以及伤口愈合过程中的分子调控网络。

Mendeley Data
2021-06-15 更新
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皮肤感染免疫转录组学分析

基本信息

创建/更新时间
2021-06-15

资源简介

该数据集包含通过RNA测序(RNAseq)技术获取的基因表达谱数据,主要研究小鼠皮肤伤口感染A组链球菌后的免疫反应。数据集包括两组小鼠样本:一组为Ncr1Cre-/HIF-1α+f/+f(野生型)小鼠的三个皮肤损伤样本(H_G_S_W1, H_G_S_W2, H_G_S_W3),另一组为Ncr1Cre+/HIF-1α+f/+f(条件性基因修饰)小鼠的三个皮肤伤口样本(H_G_S_K1, H_G_S_K2, H_G_S_K3),所有样本均在感染后第2天采集。数据来源于实验模型构建,适用于皮肤感染免疫机制、转录组学分析以及HIF-1α基因在伤口愈合中的作用等研究方向。

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https://data.mendeley.com/datasets/7nk8j9h6yp

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    • ModelScope: pip install modelscopemodelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

该数据集包含通过RNA测序(RNAseq)技术获取的基因表达谱数据,主要研究小鼠皮肤伤口感染A组链球菌后的免疫反应。数据集包括两组小鼠样本:一组为Ncr1Cre-/HIF-1α+f/+f(野生型)小鼠的三个皮肤损伤样本(H_G_S_W1, H_G_S_W2, H_G_S_W3),另一组为Ncr1Cre+/HIF-1α+f/+f(条件性基因修饰)小鼠的三个皮肤伤口样本(H_G_S_K1, H_G_S_K2, H_G_S_K3),所有样本均在感染后第2天采集。数据来源于实验模型构建,适用于皮肤感染免疫机制、转录组学分析以及HIF-1α基因在伤口愈合中的作用等研究方向。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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