白色念珠菌PEP1基因在白相中错误表达对小鼠皮肤感染模型毒力影响数据集
该数据集包含白色念珠菌WO-1菌株在PEP1基因错误表达条件下的实验数据,数据模态主要包括微生物基因表达、细胞形态观察、生理生长测试以及小鼠模型(系统性感染和皮肤感染)的毒力评估结果,主要用于研究念珠菌相变特异性基因在皮肤感染致病机制中的作用,特别是PEP1基因对菌株粘附、皮肤组织损伤能力及整体毒力的影响。
基本信息
资源简介
该数据集来源于一项微生物学研究,聚焦于白色念珠菌WO-1菌株在白相与不透明相之间的可逆表型转换。研究通过基因错误表达策略,将不透明相特异性基因PEP1(编码分泌型天冬氨酸蛋白酶)置于白相特异性基因WH11的启动子下,使其在白相细胞中异常表达。数据集包含相关的实验数据,用于分析PEP1错误表达对白相细胞形态、生理特性(如以蛋白质为唯一氮源的生长能力)以及在两种小鼠模型(系统性感染和皮肤感染)中毒力的影响。数据来源为美国微生物学会(ASM)在PubMed Central上发表的原始研究论文,主要研究方向为念珠菌的致病机制、相变调控及其在皮肤感染中的毒力因子作用。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC97079/
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来源于一项微生物学研究,聚焦于白色念珠菌WO-1菌株在白相与不透明相之间的可逆表型转换。研究通过基因错误表达策略,将不透明相特异性基因PEP1(编码分泌型天冬氨酸蛋白酶)置于白相特异性基因WH11的启动子下,使其在白相细胞中异常表达。数据集包含相关的实验数据,用于分析PEP1错误表达对白相细胞形态、生理特性(如以蛋白质为唯一氮源的生长能力)以及在两种小鼠模型(系统性感染和皮肤感染)中毒力的影响。数据来源为美国微生物学会(ASM)在PubMed Central上发表的原始研究论文,主要研究方向为念珠菌的致病机制、相变调控及其在皮肤感染中的毒力因子作用。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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