PRJNA796789：毛囊周围真皮前脂肪细胞产生抗菌物质对痤疮病理生理至关重要

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA796789

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数据说明

金黄色葡萄球菌深部组织感染的先天免疫防御由成纤维细胞协调完成，这些成纤维细胞在被触发分化为脂肪细胞后即获得抗菌能力。然而，该过程在非感染性人类疾病中的作用尚不清楚。为探究真皮成纤维细胞的脂肪生成在痤疮——一种由痤疮丙酸杆菌（Cutibacterium acnes，C. acnes）触发的疾病——中的潜在作用，研究者对人类痤疮皮损及经C. acnes刺激的小鼠皮肤进行了单细胞RNA测序。在人类痤疮和经C. acnes感染的小鼠皮肤病变的特定成纤维细胞亚群中，观察到与脂肪生成一致的转录组特征。在人类痤疮和小鼠皮肤病变中，毛囊周围真皮前脂肪细胞显示PREF1（脂肪生成的早期标志物）与cathelicidin（Camp，一种抗菌肽）共定位。C. acnes触发前脂肪细胞产生cathelicidin的能力依赖于TLR2。用维甲酸（RA）处理野生型小鼠可抑制C.

痤疮丙酸杆菌形成痤疮样皮损，抑制前脂肪细胞成脂并增强cathelicidin表达，但Camp-/-小鼠皮损无反应，尽管RA具有抗成脂作用。对痤疮患者维A酸类药物治疗后炎症皮肤的分析也显示cathelicidin诱导增强，这是维A酸类药物治疗难治性痤疮的一种此前未知的有益作用。总体而言，这些数据提供证据表明成脂性成纤维细胞是痤疮发病机制的关键组成部分，并代表未来治疗的潜在靶点。总体设计：对皮内感染痤疮丙酸杆菌或注射强化梭菌培养基（RCM）对照的小鼠皮肤活检进行单细胞RNA测序

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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