PRJNA1464594：Th2启动的固有免疫放大定义特应性皮炎内型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1464594

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

特应性皮炎（AD）在临床上具有异质性，但可重复的分子内型仍未完全明确。通过整合来自30项研究的超过1，300份皮损与非皮损皮肤转录组，我们识别出两种稳健的AD内型，它们共享一个保守的皮损核心程序，即屏障破坏和2型活化。与内型1（62%）相比，内型2（38%）以紧凑的108基因固有免疫炎症特征（包括IL1B和IL6）、髓系浸润增加以及与金黄色葡萄球菌相关的菌群失调为特征。内型分型在纵向数据集中保持稳定，全身治疗下仅出现有限且非系统性的转换。对试验和观察数据的分析提供了初步证据，表明与内型1相比，内型2在度普利尤单抗治疗下临床应答较低且残余分子活性较高。对Th2和固有免疫模块活性的交互建模揭示了一种Th2放大的固有免疫状态，可预测内型2，这与功能实验相平行，在功能实验中IL-1b/IL-6与Th2细胞因子协同作用，加剧角质形成细胞炎症并损害角质形成细胞分化。

我们的发现为阿尔茨海默病的生物学多样性提供了新的见解，并为机制分层奠定了坚实的基础，对治疗策略具有重要意义。总体设计：所提供的数据集被纳入用于联邦分析，以复现检测到的阿尔茨海默病内型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。