PRJNA1291148：成纤维细胞经Cxcl12-Cxcr4级联招募黑色素细胞促进斑马鱼炎症后色素沉着与皮肤屏障保护

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1291148

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数据说明

炎症后色素沉着（PIH）是一种常见的皮肤疾病，以褐色或黑色斑疹为特征。其可分为暂时性，通常在6–12个月内消退，或永久性，持续数年。虽然PIH的发病机制通常与局部黑素细胞过度活化有关，但这种失调的确切细胞和分子基础及其生理意义仍不明确。利用乙酸诱导的斑马鱼模型，我们确定黑素细胞迁移是色素沉着的关键驱动因素。这一过程不依赖免疫细胞，而由成纤维细胞驱动，成纤维细胞分泌Cxcl12a，通过Cxcl12a–Cxcr4a轴招募黑素细胞。成纤维细胞消融不可逆地破坏黑素细胞模式化，表明成纤维细胞异常活动决定了PIH的永久性。被招募的黑素细胞形成双重保护屏障，抵御紫外线诱导的DNA损伤和微生物入侵。该机制的转化相关性在人类PIH相关疾病（如瘢痕疙瘩、痤疮和特应性皮炎）的成纤维细胞中CXCL12表达上调得到了印证。

在治疗方面，FDA批准的CXCR4拮抗剂AMD3100（Plerixafor）在我们的模型中能有效预防和治疗PIH。我们的研究阐明了PIH中由成纤维细胞介导的黑素细胞募集机制，揭示了黑素细胞在皮肤修复中此前未被认识到的屏障功能，并提出了一种有前景的药物重定位治疗策略。总体设计：在本实验中，我们在2 dpf胚胎的四个躯干部位进行了乙酸腐蚀处理，在3 dpf时切取躯干区域，将胚胎解离为单细胞悬液，并对dsRed阳性成纤维细胞进行FACS分选。在每个生物学重复中，收集约30个胚胎，并将500个成纤维细胞分选至裂解缓冲液中。采用Smartseq2方案进行双链cDNA文库构建。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。