PLINK犬种数据揭示SLAMF1与犬特应性皮炎相关
该数据集来自 Dryad，包含基于 PLINK 的犬种基因型数据，用于研究 SLAMF1 与犬特应性皮炎（CAD）的关联
基本信息
资源简介
PLINK犬种数据揭示SLAMF1与犬特应性皮炎相关
PLINK breed data showing SLAMF1 is associated with canine atopic dermatitis
该数据集来自 Dryad，包含基于 PLINK 的犬种基因型数据，用于研究 SLAMF1 与犬特应性皮炎（CAD）的关联。研究利用中密度 SNP 芯片对超过 2.8 万只犬进行基因分型，并结合临床记录开展大规模全基因组关联分析（GWAS），在犬 38 号染色体上发现统计显著信号。数据覆盖 Labrador Retriever、Boxer、French Bulldog 等易感犬种，可用于探索 CAD 的遗传基础、验证候选基因及开展犬炎症性皮肤病的遗传关联研究（来源 DOI 解析，Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2025。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：犬特应性皮炎（CAD）是犬常见的一种炎症性皮肤病。它是一种终身性问题，由于长期皮肤不适和瘙痒（痒感），造成显著的福利问题。过度抓挠、舔舐和啃咬会导致皮肤自我损伤，并增加继发感染的风险。若干犬种易感，包括 Labrador Retriever、Boxer 和 French Bulldog，提示该病具有遗传因素。我们能够获得一个规模可观的犬群体，这些犬在中密度单核苷酸多态性（SNP）芯片上进行了基因分型，并附有相关的临床记录信息，从而可以进行大规模、高效力的全基因组关联研究（GWAS）分析。在本研究中，使用了超过 2.8 万只犬来寻找与 CAD 相关的遗传变化。我们在犬 38 号染色体上鉴定出一个统计学显著信号，其 p
【主题与分类】
主题标签：PET、Petcare、GWAS、Canine atopic dermatitis、Inflammatory skin disease、CAD、French Bulldog、Labrador、Frenchie、Boxer。本站分类：皮肤疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.np5hqc053
使用许可：Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据集大小约 1.23 GB。
数据说明
犬特应性皮炎（CAD）是犬类常见的炎症性皮肤病。这是一种终身性疾病，由于长期皮肤不适和瘙痒，构成了重大的福利问题。过度抓挠、舔舐和啃咬会导致皮肤自我损伤，并增加继发感染的风险。多个品种易患此病，包括拉布拉多寻回犬、拳师犬和法国斗牛犬，提示该病具有遗传因素。我们能够获取大量通过中密度单核苷酸多态性（SNP）芯片进行基因分型的犬只群体及其相关临床记录信息，这使得大规模、高统计效力的全基因组关联研究（GWAS）分析成为可能。本研究使用了超过2.8万只犬来寻找与CAD相关的遗传变异。我们在犬38号染色体上发现了一个统计学显著的信号，在法国斗牛犬品种中关联尤为强烈。基因组重测序揭示了SLAMF1（信号淋巴细胞激活分子1）中的一个引人注目的剪接供体变异，该基因与免疫系统相关。
对Mars Petcare Biobank进一步基因组序列和RNA样本的分析证实，SLAMF1变异是导致特应性皮炎风险增加的有力候选因素。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
