特发性炎症性肌病肌肉活检阅片者间变异性数据

该数据集来自 figshare,配套论文发表于 PLoS ONE(2014 年),主题为特发性炎症性肌病肌肉活检阅片者间变异性

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2023-05-30 更新
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其他分类immunologyClinical immunologyAutoimmune diseasesmyositisdermatomyositispolymyositisepidemiologyCancer epidemiologyInflammatory diseasesoncologyBasic cancer researchCancer detection and diagnosis
Data from: Idiopathic inflammatory myopathy: inter-rater variability in muscle biopsy reading

基本信息

模态
其他
大小
0.005383976 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-30
版本
v1

资源简介

特发性炎症性肌病肌肉活检阅片者间变异性数据

Factors Predicting Malignancy in Patients with Polymyositis and Dermatomyostis: A Systematic Review and Meta-Analysis

该数据集来自 figshare,配套论文发表于 PLoS ONE(2014 年),主题为特发性炎症性肌病肌肉活检阅片者间变异性。源站描述实际指向另一项系统综述与 Meta 分析,探讨多发性肌炎和皮肌炎患者合并恶性肿瘤的预测因素。数据包含 3 个文件(Checklist_S1.doc、Table_S1.tif、Table_S2.tif),可用于肌炎相关研究的方法学参考与阅片一致性分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Factors Predicting Malignancy in Patients with Polymyositis and Dermatomyostis: A Systematic Review and Meta-Analysis》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0094128。源站首次发布:2014-04-08。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:确定可预测 PM/DM 患者合并肿瘤性疾病的潜在因素,从而为筛查决策提供依据。方法:两名研究者独立检索 Pubmed(MEDLINE)、EMBASE、Cochrane Plus Library 和 ISI Web of Knowledge 中的文章,对研究设计或语言无限制。鉴于部分研究将 PM 和 DM 患者合并作为研究对象,而另一些研究仅纳入 DM 患者,对全部 PM/DM 合并研究以及仅纳入 DM 患者的研究分别进行 Meta 分析,以获得有信息量的结果。结果:对于 PM/DM 患者,以下因素均与恶性肿瘤风险增加相关:年龄较大、年龄大于 45 岁、男性、吞咽困难、皮肤坏死、皮肤血管炎、肌炎快速起病(35 mm/hr)、较高的 CRP 水平或抗 p155 抗体。此外,

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 5.38 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0094128。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:immunology、Clinical immunology、Autoimmune diseases、myositis、dermatomyositis、polymyositis、epidemiology、Cancer epidemiology、Inflammatory diseases、oncology。本站分类:皮肤疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Factors_Predicting_Malignancy_in_Patients_with_Polymyositis_and_Dermatomyostis_A_Systematic_Review_and_Meta_Analysis_/990248

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Lu, Xin; Yang, Hanbo; Shu, Xiaoming; Chen, Fang; Zhang, Yinli; Zhang, Sigong; et al. (2016). Factors Predicting Malignancy in Patients with Polymyositis and Dermatomyostis: A Systematic Review and Meta-Analysis. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Checklist_S1.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/1453822"
curl -L -o "Table_S1.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1453823"
curl -L -o "Table_S2.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1453824"

文件清单

  • Checklist_S1.doc(69.12 KB)
  • Table_S1.tif(4.77 MB)
  • Table_S2.tif(545.99 KB)

文件总体积 5.38 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的
明确可预测PM/DM患者合并肿瘤性疾病的潜在因素,从而为筛查决策提供依据。方法
两名研究者独立检索Pubmed(MEDLINE)、EMBASE、Cochrane Plus Library和ISI Web of Knowledge中的文献,对研究设计和语言均无限制。鉴于部分研究将PM和DM患者合并作为研究对象,而另一些研究仅纳入DM患者,故对所有PM/DM合并研究及仅纳入DM患者的研究分别进行meta分析,以获得有价值的结果。结果
对于PM/DM患者,以下因素均与恶性肿瘤风险增加相关:年龄较大、年龄大于45岁、男性、吞咽困难、皮肤坏死、皮肤血管炎、肌炎起病迅速(35 mm/hr)、CRP水平较高或抗p155抗体阳性。此外,抗ENA抗体的存在似乎与恶性肿瘤风险降低相关。

结论
从公共卫生和临床角度来看,对于具有这些已识别因素(如年龄大于45岁、男性、皮肤坏死、皮肤血管炎)的PM/DM患者,提高对早期癌症筛查的认识和实施至关重要,并为CAM的病因发病机制提供了见解。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0094128(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Factors_Predicting_Malignancy_in_Patients_with_Polymyositis_and_Dermatomyostis_A_Systematic_Review_and_Meta_Analysis_/990248)。

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