法国高加索硬皮病患者HLA共享表位比较

该数据集包含法国高加索硬皮病患者与健康对照者的HLA-DRB和DQB基因分型数据、临床亚型及自身抗体状态信息,数据模态涵盖基因序列、临床表格和mRNA表达量,主要用于研究HLA共享表位(如FLEDR和TRAELDT基序)与硬皮病发病机制、自身抗体产生的关联,为硬皮病的免疫遗传学分析和靶向治疗提供基础。

Figshare
2016-01-19 更新
免疫遗传学硬皮病分子机制
创建时间2016-01-19
更新时间2016-01-19
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https://figshare.com/articles/dataset/Comparing_HLA_Shared_Epitopes_in_French_Caucasian_Patients_with_Scleroderma/125126

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资源简介

该数据集聚焦于硬皮病(SSc)的免疫遗传学研究,旨在分析法国高加索患者群体中的HLA等位基因频率,并评估HLA-DRB和DQB等位基因所共享的两个常见氨基酸序列(67FLEDR71和71TRAELDT77)对疾病发展的影响。数据集包含468名健康对照者和282名硬皮病患者的HLA-DRB和DQB分型数据,支持FLEDR和TRAELDT基序分析,并按临床亚型(如弥漫性硬皮病)和自身抗体状态(如抗拓扑异构酶I抗体ATA)进行分层。此外,还开发了标准化的HLA-DRβ1和DRβ5逆转录酶Taqman PCR检测方法,用于定量20名携带特定HLA单倍型(HLA-DRB1*15和/或DRB1*11)受试者的mRNA表达水平。研究发现FLEDR基序与弥漫性硬皮病和ATA阳性亚组显著相关,且FLEDR基序的增加主要源于HLA-DRB1*11和DRB1*15单倍型的高频率,该基序始终由表达最丰富的β链(β1或β5)携带。该数据集为理解硬皮病的遗传易感性、自身抗体产生机制提供了关键数据,并为针对FLEDR肽结合槽的潜在治疗应用开辟了新方向。

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影像Comparing HLA Shared Epitopes in French Caucasian Patients with Scleroderma