皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤单细胞RNA测序数据
该数据集包含皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤（SPTCL）的单细胞RNA测序数据，数据模态为基因表达谱，来源于患者和健康捐赠者的多种组织样本，主要用于肿瘤研究、基因测序和免疫微环境分析，以揭示恶性细胞的转录特征、识别新型生物标志物，并探索巨噬细胞和成纤维细胞在疾病进展中的相互作用。
基本信息
资源简介
皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤单细胞RNA测序数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Table_1_Single-Cell RNA-seq Reveals Characteristics of Malignant Cells and Immune Microenvironment in Subcutaneous Panniculitis-Like T-Cell Lymphoma.xlsx》。配套论文《Subcutaneous panniculitis‐like T‐cell lymphoma in the pediatric age group: A lymphoma of low malignant potential》发表于 Pediatric Blood & Cancer（2013），DOI：10.1002/pbc.24462。源站首次发布：2021-03-18。
【数据内容】
源站原始描述：BackgroundSubcutaneous panniculitis-like T-cell lymphoma (SPTCL) is a malignant primary T-cell lymphoma that is challenging to distinguish from autoimmune disorders and reactive panniculitides. Delay in diagnosis and a high misdiagnosis rate affect the prognosis and survival of patients. The difficulty of diagnosis is mainly due to an incomplete understanding of disease pathogenesis. MethodsWe performed single-cell RNA sequencing of matched subcutaneous lesion tissue, peripheral blood, and bone…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 53.60 KB。Table_1_Single-Cell RNA-seq Reveals Characteristics of Malignant Cells and Immune Microenvironment in Subcutaneous Panniculitis-Like T-Cell Lymphoma.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，53.60 KB。数据集 DOI：10.3389/fonc.2021.611580.s002。
【主题与分类】
源站学科分类：Cancer、Haematological Tumours、Radiation Therapy、Solid Tumours、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Molecular Targets。主题标签：single-cell RNA-seq (scRNA-seq)、T cell malignancies、pediatric oncology、molecular diagnoses、subcutaneous panniculitis- like T-cell lymphoma。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cancer、Haematological Tumours、Radiation Therapy、Solid Tumours、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Molecular Targets。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Single-Cell_RNA-seq_Reveals_Characteristics_of_Malignant_Cells_and_Immune_Microenvironment_in_Subcutaneous_Panniculitis-Like_T-Cell_Lymphoma_xlsx/14235866
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Li, Zifeng; Wang, Hongsheng; Dong, Rui; Man, Jie; Sun, Li; Qian, Xiaowen; et al. (2021). Table_1_Single-Cell RNA-seq Reveals Characteristics of Malignant Cells and Immune Microenvironment in Subcutaneous Panniculitis-Like T-Cell Lymphoma.xlsx. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个单细胞RNA测序数据集，专注于研究皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤（SPTCL）的恶性细胞特征和免疫微环境。数据来源于一名SPTCL患者的匹配皮下病变组织、外周血和骨髓样本，以及健康捐赠者的外周血、骨髓、淋巴结和肺组织样本作为正常对照。通过细胞聚类、基因表达模式识别、基因差异表达分析和细胞间相互作用分析，数据集揭示了SPTCL恶性细胞的独特基因特征，包括趋化因子家族、细胞毒性蛋白、T细胞免疫检查点分子和免疫球蛋白家族，并识别了潜在的新型生物标志物（如CYTOR、CXCL13、VCAM1和TIMD4）。此外，研究还发现巨噬细胞和成纤维细胞在SPTCL恶性细胞的细胞间通讯中起主导作用。该数据集主要用于肿瘤研究、基因测序和免疫微环境分析，为理解这种罕见肿瘤的转录特性和疾病机制提供了重要资源。
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