皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤单细胞RNA测序数据

该数据集包含皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤(SPTCL)的单细胞RNA测序数据,数据模态为基因表达谱,来源于患者和健康捐赠者的多种组织样本,主要用于肿瘤研究、基因测序和免疫微环境分析,以揭示恶性细胞的转录特征、识别新型生物标志物,并探索巨噬细胞和成纤维细胞在疾病进展中的相互作用。

Frontiers
frontiersin.figshare.com
2023-06-03 更新
肿瘤研究基因测序
更新时间2023-06-03
原始链接

https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Single-Cell_RNA-seq_Reveals_Characteristics_of_Malignant_Cells_and_Immune_Microenvironment_in_Subcutaneous_Panniculitis-Like_T-Cell_Lymphoma_xlsx/14235866/1

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资源简介

该数据集是一个单细胞RNA测序数据集,专注于研究皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤(SPTCL)的恶性细胞特征和免疫微环境。数据来源于一名SPTCL患者的匹配皮下病变组织、外周血和骨髓样本,以及健康捐赠者的外周血、骨髓、淋巴结和肺组织样本作为正常对照。通过细胞聚类、基因表达模式识别、基因差异表达分析和细胞间相互作用分析,数据集揭示了SPTCL恶性细胞的独特基因特征,包括趋化因子家族、细胞毒性蛋白、T细胞免疫检查点分子和免疫球蛋白家族,并识别了潜在的新型生物标志物(如CYTOR、CXCL13、VCAM1和TIMD4)。此外,研究还发现巨噬细胞和成纤维细胞在SPTCL恶性细胞的细胞间通讯中起主导作用。该数据集主要用于肿瘤研究、基因测序和免疫微环境分析,为理解这种罕见肿瘤的转录特性和疾病机制提供了重要资源。

提供机构:Frontiers

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影像Single-Cell RNA-seq Data for Subcutaneous Panniculitis-Like T-Cell Lymphoma