2019 未经治疗的幼年型皮肌炎 RNA-Seq:总基因计数

该数据集包含2019年采集的未经治疗的幼年型皮肌炎样本的RNA-Seq基因计数数据,数据模态为基因表达谱,基于GRCh38基因组、STAR比对和featureCounts计数生成,并创新性地同时统计了未剪接和已剪转录本,主要用于青少年皮肌炎的转录组学分析和基因表达研究。

Figshare
2020-09-29 更新
浏览 37
smoothingpositionsppiregions
2019 Untreated JDM RNA-Seq: total gene counts

基本信息

大小
0.000022139 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2020-09-29
版本
v1

资源简介

2019 未经治疗的幼年型皮肌炎 RNA-Seq:总基因计数

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Smoothing positions of PPI regions》。源站首次发布:2011-12-30。

【数据内容】

源站原始描述:Copyright information: Taken from "No statistical support for correlation between the positions of protein interaction sites and alternatively spliced regions" BMC Bioinformatics 2004;5():41-41. Published online 19 Apr 2004 PMCID:PMC419334. Copyright © 2004 Offman et al; licensee BioMed Central Ltd. This is an Open Access article: verbatim copying and redistribution of this article are permitted in all media for any purpose, provided this notice is preserved along with the article''s original URL…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 22.14 KB。1471-2105-5-41-6.jpg:image/jpeg,22.14 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.2019.v1。

【主题与分类】

主题标签:smoothing、positions、ppi、regions。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/figure/Smoothing_positions_of_PPI_regions/2019

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:N Offman, Marc; N Nurtdinov, Ramil; S Gelfand, Mikhail; Frishman, Dmitrij (2011). Smoothing positions of PPI regions. figshare. Figure

【使用注意】

· 源站最后修改于 2016-01-06,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/2019_Untreated_JDM_RNA-Seq_total_gene_counts/13022534

按页面 Download 按钮获取。

数据说明

该数据集是基于GRCh38人类基因组、STAR比对工具及featureCounts计数方法生成的RNA-Seq基因表达计数数据。其特别之处在于,它统计了基因起始和终止位点内正确链上的所有读段,即同时包含了未剪接的新生转录本和已剪接的成熟转录本,而不仅限于剪接后的转录本。这一处理方式并非featureCounts的默认行为,但适用于核糖体去除文库。数据来源于未经治疗的幼年型皮肌炎(JDM)样本,主要用于青少年皮肌炎的转录组学研究和基因表达分析。

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