2019 未经治疗的幼年型皮肌炎 RNA-Seq:总基因计数

该数据集包含2019年采集的未经治疗的幼年型皮肌炎样本的RNA-Seq基因计数数据,数据模态为基因表达谱,基于GRCh38基因组、STAR比对和featureCounts计数生成,并创新性地同时统计了未剪接和已剪转录本,主要用于青少年皮肌炎的转录组学分析和基因表达研究。

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2020-09-29 更新
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青少年皮肌炎转录组学基因表达分析

基本信息

创建/更新时间
2020-09-29

资源简介

该数据集是基于GRCh38人类基因组、STAR比对工具及featureCounts计数方法生成的RNA-Seq基因表达计数数据。其特别之处在于,它统计了基因起始和终止位点内正确链上的所有读段,即同时包含了未剪接的新生转录本和已剪接的成熟转录本,而不仅限于剪接后的转录本。这一处理方式并非featureCounts的默认行为,但适用于核糖体去除文库。数据来源于未经治疗的幼年型皮肌炎(JDM)样本,主要用于青少年皮肌炎的转录组学研究和基因表达分析。

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https://figshare.com/articles/dataset/2019_Untreated_JDM_RNA-Seq_total_gene_counts/13022534

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数据说明

该数据集是基于GRCh38人类基因组、STAR比对工具及featureCounts计数方法生成的RNA-Seq基因表达计数数据。其特别之处在于,它统计了基因起始和终止位点内正确链上的所有读段,即同时包含了未剪接的新生转录本和已剪接的成熟转录本,而不仅限于剪接后的转录本。这一处理方式并非featureCounts的默认行为,但适用于核糖体去除文库。数据来源于未经治疗的幼年型皮肌炎(JDM)样本,主要用于青少年皮肌炎的转录组学研究和基因表达分析。

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