2019 未经治疗的幼年型皮肌炎 RNA-Seq:总基因计数
该数据集包含2019年采集的未经治疗的幼年型皮肌炎样本的RNA-Seq基因计数数据,数据模态为基因表达谱,基于GRCh38基因组、STAR比对和featureCounts计数生成,并创新性地同时统计了未剪接和已剪转录本,主要用于青少年皮肌炎的转录组学分析和基因表达研究。

基本信息
资源简介
2019 未经治疗的幼年型皮肌炎 RNA-Seq:总基因计数
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Smoothing positions of PPI regions》。源站首次发布:2011-12-30。
【数据内容】
源站原始描述:Copyright information: Taken from "No statistical support for correlation between the positions of protein interaction sites and alternatively spliced regions" BMC Bioinformatics 2004;5():41-41. Published online 19 Apr 2004 PMCID:PMC419334. Copyright © 2004 Offman et al; licensee BioMed Central Ltd. This is an Open Access article: verbatim copying and redistribution of this article are permitted in all media for any purpose, provided this notice is preserved along with the article''s original URL…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 22.14 KB。1471-2105-5-41-6.jpg:image/jpeg,22.14 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.2019.v1。
【主题与分类】
主题标签:smoothing、positions、ppi、regions。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.com/articles/figure/Smoothing_positions_of_PPI_regions/2019
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:N Offman, Marc; N Nurtdinov, Ramil; S Gelfand, Mikhail; Frishman, Dmitrij (2011). Smoothing positions of PPI regions. figshare. Figure
【使用注意】
· 源站最后修改于 2016-01-06,引用时请注意版本时效。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Figshare)
源站:https://figshare.com/articles/dataset/2019_Untreated_JDM_RNA-Seq_total_gene_counts/13022534
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是基于GRCh38人类基因组、STAR比对工具及featureCounts计数方法生成的RNA-Seq基因表达计数数据。其特别之处在于,它统计了基因起始和终止位点内正确链上的所有读段,即同时包含了未剪接的新生转录本和已剪接的成熟转录本,而不仅限于剪接后的转录本。这一处理方式并非featureCounts的默认行为,但适用于核糖体去除文库。数据来源于未经治疗的幼年型皮肌炎(JDM)样本,主要用于青少年皮肌炎的转录组学研究和基因表达分析。
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