特应性皮炎MendelVar示例数据集

该数据集包含基于特应性皮炎全基因组关联分析(GWAS)的MendelVar功能注释结果,数据模态为遗传变异注释表格,涵盖亚显著位点的基因座、变异影响及功能元件信息,主要用于特应性皮炎的遗传学研究,以解析疾病相关遗传变异的生物学功能和潜在机制。

Sobczyk, MariaSobczyk, Maria
Figshare
2022-02-02 更新
浏览 38
分类MendelVarGWASMendelianBioinformatics Software
Atopic Dermatitis MendelVar Example Dataset

基本信息

大小
0.010064342 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2022-02-02
版本
v5

资源简介

特应性皮炎MendelVar示例数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Atopic dermatitis MendelVar example》。项目资助方:Funded by an Academy of Medical Sciences Springboard Award [SBF003\1094].。源站首次发布:2020-11-05。

【数据内容】

源站原始描述:MendelVar annotation results for sub-significant loci Paternoster et al. (2015) atopic dermatitis GWAS. Detailed description of the output files in the "Results" section of MendelVar tutorial at

主表 disease_overlap.txt 含 20 列、样本前 189 行结构完整。

文件 do.out.inrich 为文本内容,开头为: INRICH v.1.0 : Tue Nov 3 14:11:10 2020 http://atgu.mgh.harvard.edu/inrich -…

主表 do.out.inrich.parsed 含 8 列、样本前 74 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 40 个,合计 10.06 MB。disease_overlap.txt:text/plain,140.56 KB。do.out.inrich:text/plain,178.71 KB。do.out.inrich.parsed:text/plain,8.01 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.12174864.v5。

【主题与分类】

源站学科分类:Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Applications in life sciences。主题标签:MendelVar、GWAS、Mendelian、Bioinformatics Software。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Applications in life sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Atopic_dermatitis_MendelVar_example/12174864

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Sobczyk, Maria (2020). Atopic dermatitis MendelVar example. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/Atopic_dermatitis_MendelVar_example/12174864/4

按页面 Download 按钮获取。

数据说明

该数据集基于Paternoster等人(2015年)关于特应性皮炎的全基因组关联分析(GWAS)研究,使用MendelVar工具对亚显著位点进行功能注释的结果。数据内容包括基因座注释信息、变异影响预测及相关功能元件标注,来源于公开GWAS数据的生物信息学分析。主要应用于特应性皮炎的遗传学研究,帮助解析疾病相关遗传变异的功能机制和潜在生物学通路。

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