冷诱导荨麻疹性自身炎症综合征与factor XII激活相关的图表源数据

本数据集为figshare.com发布的图表源数据,对应一篇关于冷诱导荨麻疹性自身炎症综合征的论文。功能研究显示FXII自催化裂解及接触系统激活与IL-1ß介导的炎症相关

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2023-06-01 更新
浏览 13
基因组分类AutoinflammationAutoinflammatory diseaseCoagulation Factor 12 gene (F12)Coagulation factor XII (FXII)Interleukin-1ß (IL-1ß)KallikreinBradykininUrticariaImmunoblotChromogenic assayELISAFACAS
Figure source data for Cold-induced urticarial autoinflammatory syndrome related to factor XII activation

基本信息

模态
基因组
大小
0.003406346 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

冷诱导荨麻疹性自身炎症综合征与factor XII激活相关的图表源数据

Figure source data for Cold-induced urticarial autoinflammatory syndrome related to factor XII activation

本数据集为figshare.com发布的图表源数据,对应一篇关于冷诱导荨麻疹性自身炎症综合征的论文。该病为常染色体显性遗传,与human coagulation Factor 12 gene (F12)突变相关,被命名为FXII-associated cold autoinflammatory syndrome (FACAS)。功能研究显示FXII自催化裂解及接触系统激活与IL-1ß介导的炎症相关。数据包含正文与补充图表的源数据及图像,形式为Excel XLSX文件、带标注的PowerPoint (PPTX)文件和一个TIF图像,共20个文件,可用于复核与再利用相关免疫印迹、显色及ELISA等实验结果(来源 figshare,CC 。

【数据集背景】

配套论文《Cold-induced urticarial autoinflammatory syndrome related to factor XII activation》发表于 Nature Communications(2020),DOI:10.1038/s41467-019-13984-8。项目资助方:Fritz Thyssen Foundation。源站首次发布:2020-01-14。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在随附论文中,描述了一种以冷诱导荨麻疹性皮疹和全身性炎症为特征的常染色体显性遗传病。该病与人类凝血因子12基因(F12)突变相关,并提出术语FXII相关冷自身炎症综合征(FACAS)来表示它。功能研究显示FXII的自催化裂解以及与IL-1ß介导的炎症相关的接触系统的深度激活。此处提供的数据集包含随附论文中主要和补充图表的源数据和图像。数据以Excel XLSX文件、在PowerPoint(PPTX文件)中准备的带标注图像以及一个TIF图像的组合形式提供。图2 fig2a.pptx - 图2a所依据的免疫印迹凝胶图像。fig2b.pptx - 图2b所依据的免疫印迹凝胶图像。fig2c MassSpec原始数据 - FXII肽

【数据结构与技术规格】

文件数 20 个,合计 3.41 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.11117669.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Autoimmunity、Diseases、Immunology not elsewhere classified。主题标签:Autoinflammation、Autoinflammatory disease、Coagulation Factor 12 gene (F12)、Coagulation factor XII (FXII)、Interleukin-1ß (IL-1ß)、Kallikrein、Bradykinin、Urticaria、Immunoblot、Chromogenic assay。本站分类:皮肤与结缔组织疾病/慢性荨麻疹。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Autoimmunity、Diseases、Immunology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Figure_source_data_for_Cold-induced_urticarial_autoinflammatory_syndrome_related_to_factor_XII_activation/11117669

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Scheffel, Jörg; Mahnke, Niklas Amadeus; Hofman, Zonne L M; de Maat, Steven; Wu, Jim; Bonnekoh, Hanna; et al. (2020). Figure source data for Cold-induced urticarial autoinflammatory syndrome related to factor XII activation. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "fig2c MassSpec raw data - FXII peptides in gel.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/20547024"
curl -L -o "fig2d FXIIa Chromogenic.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/20547027"
curl -L -o "fig2e FXIIa Chromogenic.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/20547030"
curl -L -o "fig3a.pptx" "https://ndownloader.figshare.com/files/20547033"
curl -L -o "fig3c PK ELISA.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/20547036"
curl -L -o "fig3d,e enzyme-C1-INH complexes ELISA.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/20547039"
curl -L -o "fig3f.pptx" "https://ndownloader.figshare.com/files/20547042"
curl -L -o "fig3g cHMWK Chromogenic.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/20547045"

文件清单

  • fig2c MassSpec raw data - FXII peptides in gel.xlsx(123.38 KB)
  • fig2d FXIIa Chromogenic.xlsx(17.07 KB)
  • fig2e FXIIa Chromogenic.xlsx(146.02 KB)
  • fig3a.pptx(54.17 KB)
  • fig3c PK ELISA.xls(26.62 KB)
  • fig3d,e enzyme-C1-INH complexes ELISA.xlsx(53.69 KB)
  • fig3f.pptx(45.37 KB)
  • fig3g cHMWK Chromogenic.xlsx(42.26 KB)
  • fig3h BK ELISA.xls(36.86 KB)
  • fig4b count_analysis neutrophils.xlsx(9.48 KB)
  • fig4b Image J example_FACAS_rgb.tif(1.38 MB)
  • fig4c IL-8 ELISA.xls(72.19 KB)
  • fig5a IL-1ß ELISA.xls(100.86 KB)
  • fig5b IL-1ß ELISA.xls(74.24 KB)
  • fig5c IL-1ß ELISA.xls(69.63 KB)
  • figSupplementary1 FXII ELISA.xlsx(23.39 KB)
  • figSupplementary2.pptx(52.15 KB)
  • figSupplementary4 IL-1ß ELISA.xlsx(22.46 KB)
  • fig2a.pptx(999.18 KB)
  • fig2b.pptx(55.82 KB)

文件总体积 3.41 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

在随附论文中,描述了一种以寒冷诱发的荨麻疹样皮疹和全身性炎症为特征的常染色体显性遗传病。该疾病与人类凝血因子12基因(F12)突变相关,并提出使用术语FXII相关寒冷性自身炎症综合征(FACAS)来指代该病。功能研究显示,FXII发生自催化裂解,并且接触系统的深度激活与IL-1β介导的炎症相关。

此处提供的数据集包含随附论文中主要图表和补充图表所依据的源数据和图像。数据以Excel XLSX文件、在PowerPoint中制备并带有标注的图像(PPTX文件)以及一个TIF图像的形式组合提供。

图2
fig2a.pptx - 图2a所依据的免疫印迹凝胶图像。
fig2b.pptx - 图2b所依据的免疫印迹凝胶图像。
fig2c MassSpec raw data - FXII peptides in gel.xlsx - 来自切取凝胶片段的原始质谱数据,图2c所依据。
fig2d FXIIa Chromogenic.xlsx - 图2d所依据的显色测定结果。
fig2e FXIIa Chromogenic.xlsx - 图2e所依据的显色测定结果。

图3
fig3a.pptx - 图3a所依据的免疫印迹凝胶。
fig3c PK ELISA.xls - 图3c所依据的ELISA结果,测量血浆前激肽释放酶。
fig3d,e enzyme-C1-INH complexes ELISA.xlsx - 图3d和3e所依据的ELISA结果,测量血浆中FXIIa-C1INH和PK-C1-INH复合物。
fig3f.pptx - 图3f所依据的免疫印迹凝胶图像。
fig3g cHMWK Chromogenic.xlsx - 图3g所依据的显色测定结果,测量cHMWK活性。
fig3h BK ELISA.xls - 图3h所依据的ELISA结果,测量缓激肽血浆水平。

图4
fig4b count_analysis neutrophils.xlsx - 来自FACAS患者病变皮肤的中性粒细胞计数,经髓过氧化物酶和α-FXIIa重链染色。
fig4b Image J example_FACAS_rgb.tif - 图4b代表性的ImageJ分析示例。
fig4c IL-8 ELISA.xls - 图4c所依据的ELISA结果,测量单核细胞IL-8分泌。

图5
fig5a IL-1ß ELISA.xls - 图5a所依据的ELISA结果。
fig5b IL-1ß ELISA.xls - 图5b所依据的ELISA结果。
f

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.11117669.v1(source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Figure_source_data_for_Cold-induced_urticarial_autoinflammatory_syndrome_related_to_factor_XII_activation/11117669)。

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