肿瘤来源的Suppressor of Fused突变揭示Hedgehog通路相互作用数据集

该数据集包含来自基底细胞癌患者的肿瘤-正常配对样本的基因组测序数据,重点研究了SUFU基因的突变及其对Hedgehog信号通路的影响,通过功能实验验证了突变导致通路异常激活的机制,适用于癌症发病机制、信号通路调控和皮肤癌基因组学等领域的研究。

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2016-12-29 更新
浏览 17
GLIHedgehog pathwayfunction SUFU variantsconstitutive pathway activationbasal cell carcinomaHedgehog transcriptional activatorHedgehog target genesSecondary driver mutationsdrive BCC formation
Tumor-Derived Suppressor of Fused Mutations Reveal Hedgehog Pathway Interactions

基本信息

大小
0.00214886 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2016-12-29
版本
v1

资源简介

肿瘤来源的Suppressor of Fused突变揭示Hedgehog通路相互作用数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Tumor-Derived Suppressor of Fused Mutations Reveal Hedgehog Pathway Interactions》。配套论文《Tumor-Derived Suppressor of Fused Mutations Reveal Hedgehog Pathway Interactions》发表于 PLOS ONE(2016),DOI:10.1371/journal.pone.0168031。源站首次发布:2016-12-28。

【数据内容】

源站原始描述:The Hedgehog pathway is a potent regulator of cellular growth and plays a central role in the development of many cancers including basal cell carcinoma (BCC). The majority of BCCs arise from mutations in the Patched receptor resulting in constitutive activation of the Hedgehog pathway. Secondary driver mutations promote BCC oncogenesis and occur frequently due to the high mutational burden resulting from sun exposure of the skin. Here, we uncover novel secondary mutations in Suppressor of Fused…

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 2.15 MB。S1 Fig.eps:application/postscript,992.09 KB。S2 Fig.eps:application/postscript,1.16 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0168031。

【主题与分类】

源站学科分类:Biophysics、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified。主题标签:GLI、Hedgehog pathway、function SUFU variants、constitutive pathway activation、Fused Mutations Reveal Hedgehog Pathway Interactions、basal cell carcinoma、Hedgehog transcriptional activator、Hedgehog target genes、Secondary driver mutations、drive BCC formation。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biophysics、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Tumor-Derived_Suppressor_of_Fused_Mutations_Reveal_Hedgehog_Pathway_Interactions/4500185

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Urman, Nicole M.; Mirza, Amar; Atwood, Scott X.; Whitson, Ramon J.; Sarin, Kavita Y.; Tang, Jean Y.; et al. (2016). Tumor-Derived Suppressor of Fused Mutations Reveal Hedgehog Pathway Interactions. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-03,引用时请注意版本时效。

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源站:https://figshare.com/articles/dataset/Tumor-Derived_Suppressor_of_Fused_Mutations_Reveal_Hedgehog_Pathway_Interactions/4500185

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数据说明

该数据集聚焦于基底细胞癌(BCC)的发病机制,通过分析来自早期散发性BCC患者的肿瘤-正常配对样本,发现了9个Suppressor of Fused(SUFU)基因的新突变。SUFU是Hedgehog信号通路的主要负调控因子,通常通过结合转录激活因子GLI1来抑制靶基因的转录。研究通过功能实验验证了其中4个突变会导致SUFU与GLI1的结合能力丧失,从而持续激活Hedgehog通路,可能作为BCC发展的驱动突变。数据集包含基因组测序数据及功能验证结果,为理解Hedgehog通路在肿瘤进展中的作用提供了关键分子证据,适用于癌症基因组学、信号通路调控及皮肤癌发病机制的研究。

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