维莫德吉治疗后分选基底细胞癌细胞的ATAC测序数据集
该数据集包含基于小鼠模型的基底细胞癌肿瘤细胞在维莫德吉药物治疗前后的ATAC测序数据，数据模态为基因测序数据，主要用于研究药物治疗对肿瘤表观遗传调控的影响，探索染色质可及性变化与癌症治疗机制的关系。
基本信息
资源简介
维莫德吉治疗后分选基底细胞癌细胞的ATAC测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《ATAC sequencing of sorted BCC cells after vismodegib treatment》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：K14Cre-ER; Ptch1fl/fl; p53fl/fl;Lgr5GFP mice were aged until the appropriate tumor density was achieved. Skin samples were taken from control mice (untreated) or mice treated for 6 days or 14 days at twice a day dosing with vismodegib (75mg/kg body weight). RNA was extracted from freshly FACS sorted tumor cells based on GFP intensity.The "SAMPLE_ID" sample characteristic is a sample identifier internal to Genentech
【主题与分类】
主题标签：小鼠、皮肤、基因组。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=3d93b0bf91d354f5909e99b181ffedb3
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 30297801
下载信息
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源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=3d93b0bf91d354f5909e99b181ffedb3
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含对K14Cre-ER; Ptch1fl/fl; p53fl/fl;Lgr5GFP小鼠模型在维莫德吉（vismodegib）药物治疗前后，基底细胞癌（BCC）肿瘤细胞的ATAC测序数据。数据来源于Genentech Inc.，通过FACS分选GFP标记的肿瘤细胞，并提取RNA进行测序，覆盖了未治疗对照组以及6天和14天治疗组（每日两次给药，75mg/kg体重）的样本。该数据集主要用于研究维莫德吉对基底细胞癌表观遗传调控的影响，探索药物治疗后肿瘤细胞的染色质可及性变化，为癌症治疗机制和药物反应研究提供支持。
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