各基因座排名前10位SNP的数据证据

数据为从最终证据数据集中提取的各基因座排名前 10 位变异的数据,主题涉及特应性皮炎、湿疹、GWAS、皮肤病学、过敏、医学遗传学与流行病学

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2020-04-15 更新
浏览 14
基因组atopic dermatitiseczemaGWASDermatologyAllergyMedical Genetics (excl. Cancer Genetics)Epidemiology
Data evidence for top 10-ranked SNPs at each locus

基本信息

模态
基因组
大小
0.001755651 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2020-04-15
版本
v1

资源简介

各基因座排名前10位SNP的数据证据

Data evidence for top 10-ranked SNPs at each locus

该数据集来自 figshare,由 Maria Sobczyk 于 2020 年 4 月 15 日发布,DOI 为 10.6084/m9.figshare.12130878.v1,包含 1 个文件 top_10_snp_broad_cats.zip。数据为从最终证据数据集中提取的各基因座排名前 10 位变异的数据,主题涉及特应性皮炎、湿疹、GWAS、皮肤病学、过敏、医学遗传学与流行病学。可用于皮肤与结缔组织疾病中特应性皮炎(湿疹)相关遗传变异的检索、整理与后续分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:Springboard award (SBF003\1094)。源站首次发布:2020-04-15。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):从最终证据数据集中提取了每个位点排名前10的变异体的数据。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 1.76 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.12130878.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Dermatology、Allergy、Medical genetics (excl. cancer genetics)、Epidemiology not elsewhere classified。主题标签:atopic dermatitis、eczema、GWAS、Dermatology、Allergy、Medical Genetics (excl. Cancer Genetics)、Epidemiology。本站分类:皮肤与结缔组织疾病/特应性皮炎(湿疹)。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Dermatology、Allergy、Medical genetics (excl. cancer genetics)、Epidemiology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Data_evidence_for_top_10-ranked_SNPs_at_each_locus/12130878

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Sobczyk, Maria (2020). Data evidence for top 10-ranked SNPs at each locus. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "top_10_snp_broad_cats.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/22308528"

文件清单

  • top_10_snp_broad_cats.zip(1.76 MB)

文件总体积 1.76 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

Extracted data from the final evidence dataset for top 10-ranked variants at each locus.

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.12130878.v1(source: https://figshare.com/articles/dataset/Data_evidence_for_top_10-ranked_SNPs_at_each_locus/12130878)。

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