NCBI基因组-Coccidioides
NCBI Genome提供Coccidioides属基因组装、注释和下载入口,可用于球孢子菌病病原基因组比较分析。 数据包含真实病例或专家标注信息,适用于围绕相关疾病开展模型训练、表型抽取、影像识别、分割、预后评估或临床自然语言处理等研究。

基本信息
资源简介
NCBI基因组-Coccidioides
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genome》。
【数据内容】
源站原始描述:Download a genome data package including genome, transcript and protein sequence, annotation and a data report
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):下载包含基因组、转录本和蛋白质序列、注释及数据报告的基因组数据包
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/?taxon=5501
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/?taxon=5501
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
NCBI Genome提供Coccidioides属基因组装、注释和下载入口,可用于球孢子菌病病原基因组比较分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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