APS 表型研究

APS 表型研究是一项面向住院成年患者的临床研究数据集,覆盖 ARDS、脓毒症和肺炎三类疾病。数据采集对象为 18 岁及以上、已患或存在 ARDS、脓毒症或肺炎风险的住院患者,内容包括临床数据、问卷以及血液、尿液、粪便等样本,接受机械通气的参与者还提供呼吸道样本,采集贯穿住院期间及出院后

Vanderbilt University Medical CenterVanderbilt University Medical Center
clinicaltrials
浏览 15
表格分类ARDSSepsisPneumonia
The APS Phenotyping Study

基本信息

模态
表格
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

APS 表型研究

The APS Phenotyping Study 是一项聚焦呼吸系统疾病与肺炎领域的临床研究数据集,来源于 clinicaltrials.gov。该研究面向住院成年患者,覆盖急性呼吸窘迫综合征(ARDS)、脓毒症和肺炎三类疾病。研究对象为 18 岁及以上、已患或存在上述疾病风险的住院患者。研究过程中将采集临床数据、问卷信息以及血液、尿液、粪便等生物样本;接受机械通气的参与者还会提供呼吸道样本。数据与样本的采集贯穿住院期间及出院后。研究旨在理解 ARDS、肺炎和脓毒症的潜在机制,目标包括将患者按生物学基础划分为不同表型类别,并为未来治疗性试验识别新的靶点。

【数据集背景】

该数据集对应一项名为 The APS Phenotyping Study 的临床研究,所属分类为呼吸系统疾病 / 肺炎,来源站为 clinicaltrials.gov。研究关注的疾病条件包括 ARDS、脓毒症和肺炎。研究的核心目标是理解 ARDS、肺炎和脓毒症的潜在机制,并在此基础上开展表型分析,具体目标包括将 ARDS、肺炎和脓毒症患者分类为基于生物学的表型类别,以及识别未来治疗性试验的新靶点。

【数据内容】

研究采集的数据与样本类型包括:临床数据、问卷信息,以及血液、尿液和粪便样本。对于接受机械通气的参与者,还会采集其呼吸道样本。数据与样本的采集时间覆盖住院期间及出院后两个阶段。数据集的主题标签为 ARDS、Sepsis、Pneumonia。

【采集与来源】

采集对象为住院成年患者,入组条件为年龄 18 岁及以上,且已患或存在发生 ARDS、脓毒症或肺炎的风险。参与研究的内容包括采集临床数据、完成问卷,以及提供血液、尿液、粪便等样本;接受机械通气的参与者还需提供呼吸道样本。数据与样本的采集贯穿住院期间及出院后。数据来源站为 clinicaltrials.gov。

【适用场景】

该数据集适用于围绕 ARDS、脓毒症和肺炎的机制研究与表型分类研究。其设计目标包括将上述疾病患者划分为基于生物学的表型类别,并识别未来治疗性试验的新靶点。因此,该数据集可支撑与疾病机制理解、患者表型划分以及治疗靶点发现相关的研究方向。

【使用方法】

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【质量与限制】

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【引用与许可】

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06521502

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:ARDS、脓毒症、肺炎。APS表型研究将招募年龄≥18岁、患有或面临ARDS、脓毒症或肺炎风险的住院成年患者。参与本研究将涉及收集临床数据、填写问卷以及采集血液、尿液和粪便等样本。接受机械通气的参与者还将提供呼吸道样本。数据和样本将在住院期间及出院后收集。将开展分析以了解ARDS、肺炎和脓毒症的潜在机制,目标包括将ARDS、肺炎和脓毒症患者按生物学基础的表型类别进行分类,并为未来的治疗试验确定新的靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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