T2MR PCR 检测化脓性脊柱炎与感染性心内膜炎患者中的 ESKAPE 病原体

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05644990

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：骨髓炎；椎体，心内膜炎，细菌性。我们的前瞻性观察性研究聚焦于使用T2细菌检测板（T2Biosystems）快速检测化脓性椎间盘炎和感染性心内膜炎的病原体。这种诊断方法结合了聚合酶链反应（PCR）和T2磁共振技术，用于从全血样本中检测细菌DNA。它能够检测出以ESKAPE缩写闻名的六种病原体（大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和粪肠球菌）。近年来，针对血流感染患者已开展了使用细菌检测板和念珠菌检测板的类似研究，为我们留下了乐观的结果。本研究旨在验证T2B是否能以更高的敏感性和特异性，以及相比传统血培养诊断更短的出结果时间，识别局部感染，特别是椎间盘炎和心内膜炎的病原体。病原体的快速检测可能缩短针对特定病原体抗生素治疗的时间，进而改善治疗结果，缩短疗程，并有助于减缓抗生素耐药性的发展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。