支气管扩张症稳定期、急性加重期与恢复期痰液微生物群及其与临床参数的关联

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源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT02315547

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数据说明

病症：支气管扩张。支气管扩张是一种以气道感染、炎症和破坏为特征的慢性气道疾病[1]。细菌常常是支气管扩张中所见恶性循环的罪魁祸首。在临床上，潜在致病微生物（PPMs）主要包括流感嗜血杆菌、副流感嗜血杆菌、铜绿假单胞菌（P. aeruginosa）、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、肺炎链球菌和卡他莫拉菌[1]。这些PPMs引发气道炎症[2-5]和生物膜形成[6]，进而导致氧化应激[7,8]。然而，不同的PPMs对支气管扩张的影响各异。例如，铜绿假单胞菌与更明显的气道炎症和较差的肺功能有关[9,10]。但应认识到，常规痰细菌培养技术仅能有效识别一小部分PPMs。检测的敏感性和特异性可能受到从采样到培养的时间、培养基和环境等因素的显著影响。细菌16SrRNA的焦磷酸测序可能为气道微生物群提供更全面的评估。

基于该技术，Goleva及其同事[11]发现了大量革兰阴性微生物群（主要是变形菌门），这可能与皮质类固醇不敏感有关。哮喘[11,12]、特发性肺纤维化[13]和支气管扩张[14,15]患者气道的微生物组也已被表征。此外，“核心微生物群”与临床参数（即FEV1）之间的关联也已得到证实。然而，既往研究存在样本量相对较小以及缺乏全面临床参数集以供进一步分析的不足。支气管扩张急性加重（BEs）的特征是症状和（或）体征显著恶化，需要抗生素治疗。触发BEs的确切机制尚未完全阐明，但

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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