生物反应器感染模型中肺炎克雷伯菌粘菌素耐药性的快速进化
粘菌素耐药性仍是耐药肺炎克雷伯菌治疗管理中的重要抗生素问题。尽管临床菌株中粘菌素耐药性的报道众多，但导致粘菌素敏感性降低的不同突变事件究竟何时以及如何发生，仍不清楚
基本信息
资源简介
生物反应器感染模型中肺炎克雷伯菌粘菌素耐药性的快速进化
该数据集聚焦于粘菌素耐药性在肺炎克雷伯菌感染模型中的快速演化过程。粘菌素耐药性仍是耐药肺炎克雷伯菌治疗管理中的重要抗生素问题，尽管临床菌株中粘菌素耐药性的报道众多，但导致粘菌素敏感性降低的不同突变事件究竟何时以及如何发生，仍不清楚。该数据集来源于 datashare.ed.ac.uk，属于呼吸系统疾病 / 肺炎分类，围绕生物反应器感染模型，记录了敏感分离株在抗生素压力下耐药性出现的基因型、表型和数学分析结果，可用于理解粘菌素耐药性在感染过程中的动态形成机制。
【数据集背景】
粘菌素是治疗耐药肺炎克雷伯菌的重要抗生素之一，但临床中粘菌素耐药性的出现给治疗管理带来持续挑战。尽管已有大量关于临床菌株粘菌素耐药性的报告，但不同突变事件究竟在何时、以何种方式发生并最终导致粘菌素敏感性降低，仍缺乏清晰认识。该数据集正是针对这一背景，利用生物反应器感染模型，对肺炎克雷伯菌敏感分离株在粘菌素压力下耐药性的出现过程进行建模和研究，以揭示耐药性快速演化的动态特征。
【数据内容】
该数据集包含对受到抗生素挑战和未受到抗生素挑战的菌群所进行的基因型、表型和数学分析结果。研究显示，在初始下降之后，菌群可在 24 小时内恢复，这一恢复由少量“奠基细胞”驱动。这些奠基细胞主要携带位于调控基因 crrB 和 pmrB 中的单点突变，其表型表现为粘菌素 MIC 比亲本菌株高出最高达 100 倍。数据集围绕这些核心发现，提供了用于描述粘菌素耐药性快速演化的相关分析内容。
【采集与来源】
该数据集来自 datashare.ed.ac.uk。其研究采用生物反应器感染模型，对肺炎克雷伯菌敏感分离株进行建模，以观察粘菌素耐药性的出现。源站描述指出，研究对受到抗生素挑战和未受到抗生素挑战的菌群均开展了基因型、表型和数学分析。除上述来源与模型信息外，源站未提供更详细的采集地点、时间范围、样本数量或仪器平台等信息。
【适用场景】
该数据集适用于研究肺炎克雷伯菌在感染模型中粘菌素耐药性的快速演化，尤其适合关注耐药突变出现时机、奠基细胞作用、crrB 和 pmrB 调控基因单点突变以及粘菌素 MIC 变化的研究场景。其分类归属于呼吸系统疾病 / 肺炎，也可为理解抗生素压力下耐药菌群动态恢复过程提供参考。源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的使用说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据读取方式、分析流程、软件依赖或复现步骤等。使用者如需使用，应依据来源站 datashare.ed.ac.uk 的说明进行访问和操作。
【质量与限制】
源站描述强调，该工作凸显了粘菌素耐药性发展的重要性，并指出耐药性可在生物反应器感染模型中快速出现。研究基于基因型、表型和数学分析，发现菌群在初始下降后 24 小时内恢复，且恢复与少量携带 crrB 和 pmrB 单点突变的奠基细胞相关，其粘菌素 MIC 可较亲本菌株高出最高达 100 倍。除这些信息外，源站未提供关于数据质量、覆盖范围、潜在偏差或使用限制的更多说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者应访问 datashare.ed.ac.uk 获取相关说明。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/8712
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
黏菌素仍是治疗耐药肺炎克雷伯菌的重要抗生素。尽管临床菌株中已有大量关于黏菌素耐药的报道，但不同的突变事件究竟在何时、如何发生并导致黏菌素敏感性降低，仍不清楚。我们利用感染生物反应器模型，在肺炎克雷伯菌的一株敏感分离株中模拟了黏菌素耐药性的出现。对接受抗生素挑战和未接受抗生素挑战的群体进行基因型、表型和数学分析表明，在初始下降之后，该群体可在24小时内恢复，这是由于少量“奠基细胞”所致；这些细胞主要携带编码crrB和pmrB的调控基因中的单点突变，其表型显示黏菌素MIC比亲本株高至多100倍。我们的工作强调，在治疗敏感肺炎克雷伯菌感染期间，黏菌素耐药性的产生很容易实现，这对将阳离子抗菌肽用作单药治疗具有重要意义。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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