PRJNA900279:重症肺炎所致ARDS患者BALF外泌体与血浆circRNA诊断标志物
该数据集来自NCBI,聚焦重症肺炎所致急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者BALF外泌体及血浆中的circRNA。源站描述显示,研究通过微阵列分析在发现队列的BALF外泌体中获取circRNA表达谱,并开展竞争性内源RNA网络构建与功能富集分析,旨在筛选和验证异常表达的circRNA并评估其诊断价值

基本信息
资源简介
PRJNA900279:重症肺炎所致ARDS患者BALF外泌体与血浆circRNA诊断标志物
PRJNA900279 数据集来自 NCBI,聚焦重症肺炎所致急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者支气管肺泡灌洗液(BALF)外泌体及血浆中的环状 RNA(circRNA)。研究旨在筛选并验证异常表达的 circRNA,并评估其对 ARDS 的诊断价值。源站描述显示,研究通过微阵列分析在发现队列的 BALF 外泌体中获取 circRNA 表达谱,并开展竞争性内源 RNA 网络构建与功能富集分析。该数据集归类于呼吸系统疾病 / 肺炎,主题标签为转录组或基因表达,可为 ARDS 相关 circRNA 生物标志物研究提供表达谱数据资源。
【数据集背景】
急性呼吸窘迫综合征是重症肺炎患者可能出现的严重并发症,其早期识别与诊断对临床管理具有重要意义。circRNA 作为一类稳定的非编码 RNA,在体液外泌体中具有较好的可检测性,因而被视为潜在的诊断生物标志物。该数据集对应的研究以重症肺炎所致 ARDS 为对象,试图从 BALF 外泌体和血浆中寻找异常表达的 circRNA,并评价其诊断价值,从而服务于 ARDS 的分子标志物筛选与机制探索。
【数据内容】
该数据集的主题标签为转录组或基因表达,核心内容是 circRNA 表达谱数据。源站描述表明,研究在发现队列的 BALF 外泌体中通过微阵列分析获得 circRNA 表达谱,并在此基础上开展竞争性内源 RNA 网络构建与功能富集分析。数据集英文名称同时提及 BALF 外泌体与血浆中的 circRNA,说明研究关注这两类样本中的 circRNA 作为重症肺炎所致 ARDS 诊断生物标志物的潜力。关于表达谱的具体样本数量、circRNA 数目、差异表达阈值及网络分析的具体结果,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述显示,circRNA 表达谱来自发现队列患者的 BALF 外泌体,采用微阵列分析获得。数据集名称还涉及血浆样本中的 circRNA。关于队列的具体构成、样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准以及伦理审批信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病尤其是重症肺炎相关 ARDS 的转录组与基因表达研究,可用于 circRNA 生物标志物的筛选与验证、BALF 外泌体与血浆 circRNA 表达特征的比较分析,以及竞争性内源 RNA 网络构建和功能富集分析等下游研究。对于关注 ARDS 分子诊断标志物、外泌体非编码 RNA 及肺炎并发症机制的研究者,该数据集具有参考价值。关于其在临床诊断流程中的直接应用,源站未提供。
【使用方法】
源站描述提及研究通过微阵列分析获取发现队列 BALF 外泌体的 circRNA 表达谱,并开展竞争性内源 RNA 网络构建与功能富集分析。使用者可据此围绕 circRNA 表达谱开展差异表达筛选、诊断价值评估相关的分析设计,以及网络构建与功能富集等生物信息学分析。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤及分析软件参数,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于微阵列分析获得 circRNA 表达谱,源站描述未提供样本量、重复数、数据质控指标及验证队列的具体信息。数据集名称提示研究涉及 BALF 外泌体与血浆两类样本,但两类样本的具体数据规模与覆盖范围源站未提供。使用时应关注发现队列与验证设计之间的差异,以及微阵列平台对 circRNA 检测的固有局限。关于数据的完整性、批次效应及缺失值情况,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI,源站未提供具体的引用文献、数据许可条款及使用限制说明。使用者在引用与再利用时应遵循 NCBI 的相关政策,并自行核实源站页面上的最新许可与引用信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA900279
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
筛选并验证重症肺炎所致ARDS患者支气管肺泡灌洗液(BALF)外泌体中异常表达的circRNA,进而评估这些circRNA对ARDS的诊断价值。总体设计:通过芯片分析发现队列BALF外泌体中的circRNA表达谱,构建竞争性内源RNA网络并进行功能富集分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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