PRJNA858819：凝集素样氧化低密度脂蛋白受体-1减轻肺炎诱导的肺损伤

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA858819

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数据说明

识别导致肺炎发病率和严重程度的宿主因素对于指导开发更有效的疗法至关重要。凝集素样氧化低密度脂蛋白受体-1（LOX-1）是一种清道夫受体，已知可促进血管损伤和炎症，但LOX-1在肺中是否发挥作用及如何发挥作用尚不清楚。在此，我们提供了LOX-1在ARDS患者和肺炎小鼠肺中大量蓄积的证据。与先前描述的LOX-1的有害作用不同，我们发现LOX-1在肺泡气腔中具有独特的保护作用，可限制蛋白性水肿和炎症。我们还鉴定出肺泡巨噬细胞和募集的中性粒细胞是肺中LOX-1表达的两个主要部位，其中巨噬细胞能够在肺炎期间进一步诱导表达，而中性粒细胞在感染肺中表现出LOX-1的快速但异质性升高。阻断LOX-1导致肺泡巨噬细胞中免疫信号失调，表现为活化标志物的改变以及炎症基因网络的伴随升高。

然而，骨髓嵌合体实验也提示中性粒细胞在LOX-1介导的肺保护中发挥重要作用，LOX-1+中性粒细胞表现出与修复过程一致的转录变化，进一步支持了这一点。综上所述，本研究确立了LOX-1在肺炎期间作为肺组织保护因子的作用，这可能通过其对肺泡巨噬细胞（AMs）和LOX-1+气腔中性粒细胞免疫信号的影响来介导。总体设计：1. 评估肺炎小鼠经抗LOX-1或对照抗体治疗后分离的肺泡巨噬细胞的转录差异 2. 评估肺炎小鼠中分离的LOX-1+与LOX-1-中性粒细胞的转录差异

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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