PRJNA635353：单细胞RNA测序识别急性呼吸窘迫综合征早期单核细胞基因特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA635353

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性呼吸窘迫综合征（ARDS）源于强烈的肺部炎症反应。我们采用单细胞RNA测序技术，以更高分辨率探究ARDS，以期深入理解其发病机制。研究将伴有早期ARDS的肺炎和脓毒症患者的外周血单个核细胞，与未发展为ARDS的脓毒症患者的外周血单个核细胞进行了比较。来自ARDS患者的单核细胞簇与未患ARDS患者的单核细胞相比，显示出多种显著特征，包括SOCS3表达下调，伴随促炎特征，多种I型IFN诱导基因上调，尤其是在CD16+细胞中。这些数据表明，ARDS患者的单核细胞上调表达的基因并不局限于与炎症相关的基因。总之，我们的发现识别了可能参与ARDS发病机制的分子，这或可为生物标志物及治疗开发提供参考。总体设计：7份冷冻PBMC样本，4份仅患脓毒症，3份患脓毒症并伴有ARDS。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。