WT与Clec1a KO小鼠原发或继发性大肠杆菌肺部感染后的肺scRNAseq数据集

该数据集为PRJNA1447939,来源于NCBI,包含野生型(WT)与Clec1a敲除(KO)小鼠在原发性或继发性大肠杆菌肺部感染后的肺组织单细胞RNA测序(scRNAseq)数据

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1447939: scRNAseq Dataset of lungs from WT and Clec1a KO mice following primary or secondary E. coli lung infection

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

WT与Clec1a KO小鼠原发或继发性大肠杆菌肺部感染后的肺scRNAseq数据集

该数据集为PRJNA1447939,来源于NCBI,包含野生型(WT)与Clec1a敲除(KO)小鼠在原发性或继发性大肠杆菌肺部感染后的肺组织单细胞RNA测序(scRNAseq)数据。研究关注肺炎相关免疫抑制中髓系免疫细胞的重塑,以及C型凝集素受体CLEC-1在免疫检查点中的作用。数据可用于比较不同基因型与感染模式下肺部细胞转录组差异,探索CLEC-1对先天免疫应答和T细胞反应的调控,为肺炎与脓毒症诱导免疫抑制机制研究提供转录组资源(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肺炎与显著的发病率和死亡率相关,是全球住院和死亡的主要原因。脓毒症表现出炎症增强与免疫抑制交替的阶段。脓毒症诱导的免疫抑制以髓系免疫区室的深度重塑为特征,使患者易患更严重的继发性感染。模式识别受体(PRRs),如C型凝集素受体(CLRs)家族,能够响应多种内源性和外源性配体,调节大量先天免疫应答。我们之前将CLR CLEC-1描述为坏死细胞的受体,由髓系细胞如常规1型树突状细胞(cDC1)表达,能够限制抗原呈递和下游T细胞反应。因此,我们评估了这种新型免疫检查点在th

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:呼吸系统疾病/肺炎。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1447939

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺炎与显著的发病率和死亡率相关,是全球范围内导致住院和死亡的主要原因。脓毒症表现出炎症增强期与免疫抑制期交替出现的特征。脓毒症诱导的免疫抑制以髓系免疫区室的深度重塑为特征,使患者易受更严重形式的继发感染。模式识别受体(PRRs),如C型凝集素受体(CLRs)家族,能够对多种内源性和外源性配体作出反应,调节大量先天免疫应答。我们此前将CLR CLEC-1描述为一种由髓系细胞(如常规I型树突状细胞(cDC1))表达的坏死细胞受体,能够限制抗原呈递及下游T细胞应答。因此,我们评估了这一新型免疫检查点在脓毒症初期促炎阶段以及后期炎症消退阶段中的作用。为此,我们在C57BL6 Clec1a缺陷小鼠中进行了大肠杆菌肺部原发性和继发性感染,并通过scRNAseq分析了感染后第1天和第3天的免疫应答。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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