基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1406780：早期辅助抗PD-L1治疗改善小鼠肺毛霉病结局并逆转免疫麻痹

该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，编号 1406780，英文名称为“Early adjunct anti-PD-L1 therapy improves outcomes and reverses immune paralysis in murine pulmonary mucormycosis”。从名称可以看出，该研究围绕小鼠肺毛霉病模型展开，关注早期辅助抗 PD-L1 治疗对疾病结局的改善作用以及对免疫麻痹状态的逆转效果。数据集在分类上归属于呼吸系统疾病 / 肺炎方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其涉及转录组或基因表达层面的数据。BioProject 作为生物数据集合，用于汇集由单一机构或联盟发起的同一研究计划下产生的多种数据类型，并为用户提供统一入口以查找相关数据链接。该数据集即通过 NCBI BioProject 平台对外发布，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

肺毛霉病是一种累及呼吸系统的严重感染性疾病，常与免疫功能受损状态相关。该数据集所对应的研究聚焦于小鼠肺毛霉病模型，探索在疾病早期阶段辅以抗 PD-L1 治疗是否能够改善治疗结局，并考察其对免疫麻痹状态的逆转作用。研究主题涉及免疫治疗与感染性疾病之间的交互，属于呼吸系统疾病与肺炎相关研究方向。项目通过 BioProject 形式组织，旨在将同一研究计划下产生的生物数据进行集中收录与关联，便于后续查找与使用。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明其数据内容与转录组或基因表达相关。BioProject 记录本身并不直接等同于某一类具体数据文件，而是作为项目层面的集合，提供指向该项目所生成各类数据的链接入口。因此，该数据集的内容涵盖与“早期辅助抗 PD-L1 治疗改善小鼠肺毛霉病结局并逆转免疫麻痹”这一研究主题相关的转录组或基因表达数据。关于具体样本数量、测序平台、基因列表、表达矩阵或差异表达结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1406780，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是由单一组织或联盟发起的、针对某一研究计划所产生生物数据的集合，其记录为用户提供统一位置，以查找该项目下不同类型数据所对应的链接。该项目的源站标题为“Early adjunct anti-PD-L1 therapy improves outcomes... (ID 1406780) - BioProject - NCBI”。关于样本采集地点、时间、实验动物品系、处理分组、测序机构等具体采集信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与呼吸系统疾病、肺炎、肺毛霉病以及免疫治疗相关的转录组或基因表达研究场景。研究人员可将其用于了解早期辅助抗 PD-L1 治疗对小鼠肺毛霉病模型结局及免疫麻痹状态影响的相关数据基础，也可作为转录组或基因表达方向的数据资源进行检索与关联分析。由于该数据集归属于 BioProject，其适用场景还包括通过项目入口查找同一研究计划下不同数据类型之间的关联信息。关于更具体的分析用途或推荐应用方向，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 平台，以项目编号 1406780 进行检索，访问该项目的记录页面，并通过记录中提供的链接查找该项目所生成的不同类型数据。BioProject 记录的设计目的即在于为用户提供单一入口，以便定位与同一研究计划相关的多种数据。关于数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具等具体使用说明，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集通过 NCBI BioProject 平台发布，属于项目层面的数据集合记录。其质量与限制的具体信息，如数据完整性、测序深度、样本量、批次效应、统计方法或验证情况等，源站未提供。用户在使用时应结合 BioProject 记录中指向的原始数据及其相关说明进行判断。该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，但关于数据的具体质量指标，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。用户如需引用或使用该数据集，应参考 NCBI BioProject 项目页面及相关数据链接中给出的说明。关于具体的许可协议或授权信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317352

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1406780

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

侵袭性肺毛霉病（IPM）是一种严重的机会性霉菌感染，其结局主要由宿主因素决定。临床前概念验证研究和挽救治疗背景下的临床病例报告提示，免疫检查点抑制剂（ICIs）在IPM管理中可能获益。然而，感染诱导的免疫麻痹动力学及ICI治疗的最佳时机仍知之甚少。在此，我们对环磷酰胺免疫抑制的IPM小鼠（少根根霉感染）肺组织进行了基于nCounter的序贯转录组学分析，以动态研究肺部免疫环境。感染后7天内，IPM小鼠肺部显示早期促炎信号逆转、T细胞信号受损以及耗竭标志物上调。在侵袭性肺曲霉病和镰刀菌病小鼠中也观察到类似的免疫麻痹特征。在治疗研究中，于IPM感染后第3天开始使用对毛霉目有活性的抗真菌药物硫酸艾沙康唑（ISAV），同时给予抗PD-L1或非靶向同型抗体（对照），分别于第3+5天（早期）或第6+8天（晚期）给药。

与ISAV+同型对照相比，早期和晚期辅助抗PD-L1治疗均耐受良好，并显著改善了发病率/死亡率结局。值得注意的是，与晚期辅助抗PD-L1治疗和同型对照相比，早期辅助抗PD-L1治疗显著促进了更强的先天免疫细胞活化、关键细胞因子通路的上调、T辅助细胞信号传导的恢复以及IPM诱导的耗竭信号的逆转。这些发现表明，联合抗真菌和早期免疫调节治疗可能是拦截免疫麻痹并改善IPM免疫功能低下宿主结局的重要策略，值得进一步开展临床前和临床探索，以研究早期宿主导向干预治疗致命性霉菌性肺炎。总体设计：八周龄雌性BALB/c小鼠被免疫抑制

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别