分离的人hBEC供体人口统计学数据

该数据集来自plos.figshare.com,包含1个Table 1.xls文件,记录分离的人颊黏膜上皮细胞(hBEC)的供体人口统计学信息

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2023-06-30 更新
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Donor demographic of isolated hBEC.

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000005632 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-30
版本
v1

资源简介

分离的人hBEC供体人口统计学数据

Donor demographic of isolated hBEC.

该数据集来自plos.figshare.com,包含1个Table 1.xls文件,记录分离的人颊黏膜上皮细胞(hBEC)的供体人口统计学信息。数据关联一项构建由永生化人声带成纤维细胞与原代人颊黏膜上皮细胞组成的黏膜替代物的研究,构建物(n=3)在组织学和蛋白质组学层面与天然喉黏膜进行比较。该数据可用于声带瘢痕相关组织工程研究的供体特征参考(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023-06-30。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):人类声带(VF)生物学研究受到若干因素阻碍。VF黏膜敏感的微结构是其中之一,它限制了体内研究,因为活检带来极高的瘢痕风险。由VF上皮细胞和VF成纤维细胞(VFF)组成的喉器官型模型可能克服其中一些局限。与有多种形式可供使用的人VFF不同,VF上皮细胞的可得性稀缺。颊黏膜可能是上皮细胞的良好替代来源,因为它易于获取,且活检愈合后不留瘢痕。因此,本项目生成了由永生化人VF成纤维细胞和原代人颊黏膜上皮细胞组成的替代构建物。这些构建物(n = 3)在组织学和蛋白质组学层面与天然喉黏膜进行了比较。工程化构建物重新组装成黏膜-黏

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 5.63 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0287634.t001。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Space Science、Medicine、Molecular Biology、Biotechnology、Chemical Sciences not elsewhere classified。主题标签:significantly different abundance、layered stratified epithelium、immunohistochemical staining confirmed、muscle cells within、proteomic analysis resulted、human vocal fold、buccal mucosa might、native laryngeal mucosa、like structure resembling、good alternative source。本站分类:耳鼻咽喉疾病/声带瘢痕。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Space Science、Medicine、Molecular Biology、Biotechnology、Chemical Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Donor_demographic_of_isolated_hBEC_/23609900

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Grossmann, Tanja; Kirsch, Andrijana; Grill, Magdalena; Steffan, Barbara; Karbiener, Michael; Brcic, Luka; et al. (2023). Donor demographic of isolated hBEC.. PLOS ONE. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table 1.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/41417192"

文件清单

  • Table 1.xls(5.63 KB)

文件总体积 5.63 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

人类声带(VF)生物学研究受到多种因素的阻碍。声带黏膜敏感的微结构是其中之一,限制了体内研究,因为活检具有极高的瘢痕形成风险。由声带上皮细胞和声带成纤维细胞(VFF)构成的喉器官型模型可能克服其中一些局限。与有多种形式可供使用的人声带成纤维细胞不同,声带上皮细胞的获取十分稀缺。颊黏膜可能是上皮细胞的良好替代来源,因为它易于获取,且活检愈合后不留瘢痕。因此,本项目构建了由永生化人声带成纤维细胞和原代人颊上皮细胞组成的替代构建体。将这些构建体(n = 3)在组织学和多组学水平与天然喉黏膜进行了比较。工程化构建体在培养35天后重新组装成黏膜样结构。免疫组化染色证实了多层复层上皮、类似基底膜且IV型胶原阳性的屏障样结构,以及含声带成纤维细胞的下层结构。

蛋白质组学分析共鉴定并定量了1961种蛋白质。其中,83.8%在天然声带黏膜和构建物中均被检出,仅有53种蛋白质丰度存在显著差异。15.3%的检出蛋白质仅在天然声带黏膜中鉴定到,这很可能归因于声带样本中的内皮细胞、免疫细胞和肌肉细胞,而0.9%的蛋白质仅在构建物中发现。基于易于获取的细胞来源,我们证明我们的喉黏膜模型与天然声带黏膜具有许多共同特征。它提供了一种可替代且可重复的体外模型,并为从声带生物学研究到干预措施测试(例如药物测试)等诸多研究提供了机会。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0287634.t001(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Donor_demographic_of_isolated_hBEC_/23609900)。

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