CPTAC头颈鳞癌影像组学集合
CPTAC头颈鳞癌影像组学集合公开提供多模态数据，围绕头颈肿瘤多模态组学相关病例、标注或临床/组学信息，适合用于分类、算法训练、外部验证、表型分析和疾病机制探索。
基本信息
资源简介
CPTAC头颈鳞癌影像组学集合
【一句话概览】
本数据集是 TCIA 公开的多模态数据集，收录 合计 343.08 GB、207 例受试者，主题涵盖 Head and Neck Cancer，可用于跨模态对齐与融合建模研究，CC BY 4.0 许可开放获取。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《The Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Collection》。源站首次发布：2025/02/26。
【数据内容】
源站原始描述：All CPTAC cohorts are released as either a single combined cohort, or split into Discovery and Confirmatory where applicable. There are two main types of proteomic studies: discovery proteomics and targeted proteomics. The term "discovery proteomics" is in reference to "untargeted" identification and quantification of a maximal number of proteins in a biological or clinical sample. The term “targeted proteomics” refers to quantitative measurements on a defined subset of total proteins in a biolo…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：所有 CPTAC 队列均以单一合并队列的形式发布，或在适用情况下分为 Discovery 和 Confirmatory 发布。蛋白质组学研究主要有两种类型：发现蛋白质组学和靶向蛋白质组学。术语“发现蛋白质组学”指的是对生物或临床样本中最大数量的蛋白质进行“非靶向”鉴定和定量。术语“靶向蛋白质组学”指的是对生物或临床样本中总蛋白质的特定子集进行定量测量，通常是在发现蛋白质组学研究完成后进行，以确认所选定的感兴趣靶标。常用的蛋白质组学技术和平台包括不同类型的质谱和蛋白质微阵列，具体取决于分析的需求、通量和样本输入要求；同时，纳米技术和自动化正在进一步开发中，以提高低丰度蛋白质的检测、增加通量，并在体内选择性地到达目标蛋白。一旦识别出感兴趣的蛋白质靶标，就会开发高通量靶向检测用于验证性研究：即确认初始检测准确的测试。CPTAC 成像工作的摘要可在 CPTAC Imaging Proteomics 页面找到。
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.7937/K9/TCIA.2018.UW45NH81。
【主题与分类】
源站学科分类：CT、MR、PT、Histopathology、Whole Slide Image。主题标签：Head and Neck Cancer。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cptac-hnscc/
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：National Cancer Institute Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC). (2018). The Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Collection (CPTAC-HNSCC) (Version 19) [dataset]. The Cancer Imaging Archive
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（TCIA 标准方式）
方式一：NBIA 搜索
- 打开 NBIA 搜索页（免费注册 TCIA 账号）；
- 按本数据集 Collection 名称筛选（见源站页面），加入 Download Basket；
- 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。
方式二：NBIA API（程序化）
curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json
方式三：TCIA Manifest + dicomsort
在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。
数据集大小约 343.08 GB。
数据说明
CPTAC头颈鳞癌影像组学集合是与头颈肿瘤多模态组学相关的公开数据集，包含多模态数据，可用于分类、分型、诊断或预后研究。
数据加载示例（DICOM 影像）
import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array
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