小鼠慢性可传播性中耳炎模型
该数据集来自 plos.figshare.com,对应 2019 年 PLOS Pathogens 论文,包含 11 个文件(docx 与 xlsx 格式),围绕小鼠慢性、可传播性中耳炎模型

基本信息
资源简介
小鼠慢性可传播性中耳炎模型
A model of chronic, transmissible Otitis Media in mice
该数据集来自 plos.figshare.com,对应 2019 年 PLOS Pathogens 论文,包含 11 个文件(docx 与 xlsx 格式),围绕小鼠慢性、可传播性中耳炎模型。源站描述指出,Bordetella pseudohinzii 可自然、高效、快速地经咽鼓管上行定植中耳,引起急性和慢性组织病理学改变及听力进行性下降,较真实地模拟人类中耳炎。数据可用于研究中耳炎的病原定植、炎症与听力损伤机制(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《A model of chronic, transmissible Otitis Media in mice》发表于 PLOS Pathogens(2019),DOI:10.1371/journal.ppat.1007696。源站首次发布:2019-04-10。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):中耳的感染和炎症是急性和慢性中耳炎(OM)的特征,是就医和开具抗生素处方的主要原因,尤其在儿童中。与人类 OM 常相关的人鼻咽病原体不会自然定植于啮齿类动物的中耳,多数实验模型涉及将大量人类病原体直接注射到啮齿类动物的中耳鼓泡中,在那里它们引起短暂的急性炎症但无法持续存在。在此我们报告,Bordetella pseudohinzii——一种小鼠呼吸道病原体——自然、高效且快速地经咽鼓管上行定植中耳,引起急性和慢性组织病理学改变,并伴有听力敏锐度的进行性下降,密切模拟人类中耳炎。实验室小鼠经鼻内实验接种
【数据结构与技术规格】
文件数 11 个,合计 612.03 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.ppat.1007696。
【主题与分类】
源站学科分类:Medicine、Microbiology、Genetics、Physiology、Biotechnology、Evolutionary Biology。主题标签:middle ear、mimics otitis media、OM、iconic mouse model、pathogen、middle ears、middle ear bullae、titis m edia、otitis media。本站分类:耳鼻咽喉疾病/耳部感染(中耳炎)。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology、Genetics、Physiology、Biotechnology、Evolutionary Biology。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/A_model_of_chronic_transmissible_Otitis_Media_in_mice/7979579
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Dewan, Kalyan K.; Taylor-Mulneix, Dawn L.; Campos, Laura L.; Skarlupka, Amanda L.; Wagner, Shannon M.; Ryman, Valerie E.; et al. (2019). A model of chronic, transmissible Otitis Media in mice. PLOS Pathogens. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取(Figshare)
- 源站标题:A model of chronic, transmissible Otitis Media in mice
- DOI:10.1371/journal.ppat.1007696
- 发布日期:2019-04-10
- 文件数:11 个
- 文件总体积:612.03 KB
- 源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/A_model_of_chronic_transmissible_Otitis_Media_in_mice/7979579
命令行下载
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文件清单
ppat.1007696.s001.docx(73.88 KB)ppat.1007696.s002.docx(185.03 KB)ppat.1007696.s003.docx(56.98 KB)ppat.1007696.s004.xlsx(27.62 KB)ppat.1007696.s005.xlsx(21.22 KB)ppat.1007696.s006.xlsx(74.13 KB)ppat.1007696.s007.xlsx(21.01 KB)ppat.1007696.s008.xlsx(21.09 KB)ppat.1007696.s009.xlsx(90.11 KB)ppat.1007696.s010.xlsx(20.70 KB)ppat.1007696.s011.xlsx(20.27 KB)
文件总体积 612.03 KB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
急性和慢性中耳炎(OM)特征性的中耳感染与炎症,是就医和开具抗生素处方的主要原因之一,尤其在儿童中更为常见。与人类OM常相关的鼻咽部病原体并不会自然定植于啮齿类动物的中耳,而大多数实验模型是将大量人类病原体直接注射到啮齿类动物的中耳鼓泡中,在那里它们引起短暂的急性炎症,但无法持续存在。在此,我们报道,假欣氏鲍特菌(Bordetella pseudohinzii)——一种小鼠呼吸道病原体——能够自然、高效且快速地沿咽鼓管上行定植于中耳,引起急性和慢性组织病理学改变,并伴随听力敏锐度的进行性下降,高度模拟人类中耳炎。经鼻内实验接种极低数量细菌的实验室小鼠,其中耳持续被定植,并随后将细菌传播给同笼伙伴。
利用小鼠中专门构建且特征明确的免疫缺陷模型,我们开展了实验,以揭示T细胞和B细胞在慢性中耳炎期间控制中耳细菌数量方面的不同作用。这一经典小鼠模型为阐明中耳炎中宿主-病原体相互作用的各个方面提供了显著优势,而这些方面目前使用其他动物模型无法实现。这一天然的中耳炎模型允许研究宿主间的传播、呼吸道的有效早期定植、咽鼓管的上升途径,以及中耳的定植、致病机制和持续存在。该模型还允许将小鼠分子免疫学和细菌遗传学的强大工具相结合,以确定这些重要过程的机制基础。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.ppat.1007696(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/A_model_of_chronic_transmissible_Otitis_Media_in_mice/7979579)。
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