PDDCA头颈部自动分割挑战数据

鼻中隔偏曲研究可借助PDDCA进行头颈解剖基线分割和影像预处理,支持鼻腔气道建模和邻近结构识别。

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PDDCA
2015-01-01 更新
浏览 36
图像图像分割head and neckCTsegmentationcomputational anatomyradiation therapyparotid glandsbrainstemoptic chiasmoptic nervesmandiblesubmandibular glandsbony landmarks
PDDCA Head and Neck Auto Segmentation Challenge

基本信息

模态
图像
数据量
48
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2015-01-01

资源简介

PDDCA头颈部自动分割挑战数据

【一句话概览】

PDDCA 1.4.1 是由 Gregory C. Sharp 博士团队维护的公共计算解剖数据库,包含 48 例头颈部 CT 图像,来自 RTOG 0522 研究,并提供左右腮腺、脑干、视交叉、左右视神经、下颌骨、左右颌下腺的手工分割及骨性标志手工标注。该数据曾用于 2015 年头颈部自动分割 MICCAI 挑战赛,数据库分为三个压缩文件,第三部分缺少部分上述结构(来源 imagenglab.com)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《PDDCA》。

【数据内容】

源站原始描述:PDDCA A Public Domain Database for Computational Anatomy version 1.4.1 This database is provided and maintained by Dr. Gregory C Sharp (Harvard Medical School – MGH, Boston) and his group. The data here provided have been used for the “Head and Neck Auto Segmentation MICCAI Challenge (2015)”. To cite the challenge or the data, please refer to: Raudaschl, P. F., Zaffino, P., Sharp, G. C., Spadea, M. F., Chen, A., Dawant, B. M., … & Jung, F. (2017). Evaluation of segmentation methods on head and n…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):PDDCA 计算解剖学公共领域数据库 版本 1.4.1 本数据库由 Gregory C Sharp 博士(哈佛医学院 – 波士顿麻省总医院)及其团队提供和维护。此处提供的数据已用于“头颈部自动分割 MICCAI 挑战赛(2015)”。如需引用该挑战赛或数据,请参考:Raudaschl, P. F., Zaffino, P., Sharp, G. C., Spadea, M. F., Chen, A., Dawant, B. M., … & Jung, F. (2017). Evaluation of segmentation methods on head and neck CT: Auto‐segmentation challenge 2015. Medical Physics, 44(5), 2020-2036. PDDCA 版本 1.4.1 包含来自放射治疗肿瘤学组(RTOG)0522 研究(由 Kian Ang 博士领导的多机构临床试验)的 48 例患者 CT 图像,以及左右腮腺、脑干、视交叉、视神经(左右两侧)、下颌骨、颌下腺(左右两侧)的手动分割和骨性标志的手动识别。我们将这些数据提供给社区,希望能有所帮助。任何勾画和标记中的错误均归我们所有,并非参与医生之过。请参阅 pddca.odt 获取完整信息。出于实际原因,数据库分为 3 个压缩文件。第 3 部分包含缺少上述某些结构的图像。

【主题与分类】

主题标签:head and neck、CT、segmentation、computational anatomy、radiation therapy、parotid glands、brainstem、optic chiasm、optic nerves、mandible。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.imagenglab.com/newsite/pddca/

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

头颈部CT多器官分割数据,可用于鼻咽和颅面邻近结构定位。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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