鼻窦微生物组微生态分型数据集

资源简介

鼻窦微生物组微生态分型数据集

Data_Sheet_1_Microbiotyping the Sinonasal Microbiome.ZIP

该数据集来自 International Sinonasal Microbiome Study（ISMS）的 410 份鼻窦拭子样本，采用无监督机器学习方法结合降维与聚类，对鼻窦微生物组进行微生态分型研究。研究提出三种主要鼻窦微生态型：Corynebacterium 主导型、Staphylococcus 主导型，以及由 Streptococcus、Haemophilus、Moraxella 和 Pseudomonas 等其他核心属主导型。三种微生态型在健康与病变鼻窦中的流行率无差异，但其分布随地理区域不同而存在差异，并描述了 Corynebacterium 与 Staphylococcus aureus 之间可能存在的相互制约关系。。

【数据集背景】

配套论文《Microbiotyping the sinonasal microbiome》发表于 期刊（2019），DOI：10.1101/549311。源站首次发布：2020-04-08。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究通过一种结合降维与聚类的无监督机器学习方法，对鼻窦微生物组进行了新颖的描述。我们将该方法应用于 International Sinonasal Microbiome Study（ISMS）数据集的 410 份鼻窦拭子样本。我们提出三种主要的鼻窦“微生态型”或“状态”：第一种由 Corynebacterium 主导，第二种由 Staphylococcus 主导，第三种由鼻窦微生物组的其他核心属（Streptococcus、Haemophilus、Moraxella 和 Pseudomonas）主导。所研究的三种微生态型在健康与病变鼻窦之间的流行率没有差异，但其分布因地理区域而存在明显差异。我们还描述了 Corynebacterium 物种与 Staphylococcus aureus 之间潜在的相互制约关系，提示某种微生物平衡可能存在于 vari

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 937.43 KB。数据集 DOI：10.3389/fcimb.2020.00137.s002。

【主题与分类】

源站学科分类：Medical Bacteriology、Medical Infection Agents (incl. Prions)、Medical Virology、Clinical Microbiology。主题标签：microbiome、sinus、next-generation sequencing、16S rRNA gene、chronic rhinosinusitis、microbiotype、paranasal sinuses。本站分类：耳鼻咽喉疾病/慢性鼻窦炎。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medical Bacteriology、Medical Infection Agents (incl. Prions)、Medical Virology、Clinical Microbiology。

【获取与许可】

源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Microbiotyping_the_Sinonasal_Microbiome_ZIP/12095358

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Bassiouni, Ahmed; Paramasivan, Sathish; Shiffer, Arron; Dillon, Matthew R.; Cope, Emily K.; Cooksley, Clare; et al. (2020). Data_Sheet_1_Microbiotyping the Sinonasal Microbiome.ZIP. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。