人类胚胎肢体谱系特异性调控活动的演化
该数据集通过比较人类、猕猴和小鼠肢体发育过程中的H3K27ac修饰,从全基因组层面研究顺式调控演化。H3K27ac可定量反映启动子和增强子活性

基本信息
资源简介
人类胚胎肢体谱系特异性调控活动的演化
The Evolution of Lineage-Specific Regulatory Activities in the Human Embryonic Limb
该数据集通过比较人类、猕猴和小鼠肢体发育过程中的H3K27ac修饰,从全基因组层面研究顺式调控演化。H3K27ac可定量反映启动子和增强子活性。研究发现,自人类-猕猴分化以来,13%的启动子和11%的增强子在人类谱系中获得活性,这些增益多源于肢体祖先调控活性的改变或其他组织的潜在共选,遗传成因可能异质。数据可用于解析人类肢体发育调控演化及人类特异性调控功能(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):人类解剖特征的演化可能涉及发育过程中基因调控的改变。然而,人类特异性发育调控功能的性质与程度仍不清楚。我们通过比较人类、猕猴和小鼠肢体发育过程中的组蛋白修饰H3K27ac(可定量反映启动子和增强子活性),获得了人类胚胎组织中顺式调控演化的全基因组视图。基于H3K27ac的增加,我们发现自人类-猕猴分化以来,13%的启动子和11%的增强子在人类谱系中获得了活性。这些增益主要源于肢体中祖先调控活性的改变或其他组织的潜在共选,并可能具有异质的遗传成因。在人类中表现出活性增益的大多数增强子起源于哺乳动物。启动子中的增益……
【主题与分类】
主题标签:ChIP-seq、RNA-seq of coding RNA、Macaca mulatta、Mus musculus、Homo sapiens。本站分类:其他/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-42413
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数据说明
E41 gestational day E50 gestational day E33 gestational day E47 gestational day E48 gestational day E11.5 gestational day E49 gestational day E36 gestational day E46 gestational day E13.5 gestational day E45 gestational day E51 … 2 other values hindlimb autopod forelimb autopod hindlimb digit 1
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