CHIA

Name: CHIA
Creator: bigbio
License: cc-by-4.0

CHIA是一个包含12,409条标注的临床试验入组与排除标准的大规模语料库，支持命名实体识别和关系抽取任务。

bigbio

Hugging Face

2022-12-22 更新

文本临床试验命名实体识别

基本信息

模态

文本

大小

0.28 GB

许可

cc-by-4.0

创建/更新时间

2022-12-22

资源简介

CHIA是一个从ClinicalTrials.gov注册的1000项介入性IV期临床试验中提取的患者入组与排除标准的大规模标注语料库。包含12,409条标注的资格标准，涵盖15类实体（共41,487个唯一实体）和12类关系（共25,017条关系），支持命名实体识别（NER）和关系抽取（RE）任务。

原始链接

https://huggingface.co/datasets/bigbio/chia

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使用方式

数据集获取与加载（Hugging Face datasets）

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("bigbio/chia")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"

git lfs install &amp;&amp; git clone https://hf-mirror.com/datasets/bigbio/chia

仓库文件结构

.gitattributes
README.md
bigbiohub.py
chia.py

数据集卡片摘录（源站说明）

language:

en
bigbio_language:
English
license: cc-by-4.0
multilinguality: monolingual
bigbio_license_shortname: CC_BY_4p0
pretty_name: CHIA
homepage: https://github.com/WengLab-InformaticsResearch/CHIA
bigbio_pubmed: False
bigbio_public: True
bigbio_tasks:
NAMED_ENTITY_RECOGNITION
RELATION_EXTRACTION

Dataset Card for CHIA

Dataset Description

Homepage: https://github.com/WengLab-InformaticsResearch/CHIA
Pubmed: False
Public: True
Tasks: NER,RE

A large annotated corpus of patient eligibility criteria extracted from 1,000
interventional, Phase IV clinical trials registered in ClinicalTrials.gov. This
dataset includes 12,409 annotated eligibility criteria, represented by 41,487
distinctive entities of 15 entity types and 25,017 relationships of 12
relationship types.

Citation Information

@article{kury2020chia,
  title        = {Chia, a large annotated corpus of clinical trial eligibility criteria},
  author       = {
    Kury, Fabr{''\i}cio and Butler, Alex and Yuan, Chi and Fu, Li-heng and
    Sun, Yingcheng and Liu, Hao and Sim, Ida and Carini, Simona and Weng,
    Chunhua
  },
  year         = 2020,
  journal      = {Scientific data},
  publisher    = {Nature Publishing Group},
  volume       = 7,
  number       = 1,
  pages        = {111}
}