人前额叶皮层组织转录组数据集 - ALS vs CTR
该数据集来源于 EGA 归档，提供人前额叶皮层组织的转录组数据，按肌萎缩侧索硬化（ALS）与对照（CTR）分组。数据覆盖 ALS 患者与对照人群的前额叶皮层样本，可用于比较两组间的基因表达差异，支持 ALS 相关分子机制探索、候选生物标志物筛选以及基于转录组特征的分类建模等研究（来源 EGA）
基本信息
资源简介
人前额叶皮层组织转录组数据集 - ALS vs CTR
该数据集为来源于 EGA 归档的人前额叶皮层组织转录组数据集，英文名称为 Transcriptomics dataset from human prefrontal cortex tissue - ALS vs CTR，按肌萎缩侧索硬化（ALS）与对照（CTR）分组。数据覆盖 ALS 患者与对照人群的前额叶皮层样本，可用于比较两组间的基因表达差异，支持 ALS 相关分子机制探索、候选生物标志物筛选以及基于转录组特征的分类建模等研究。数据集在站内归入神经系统疾病 / 其他分类，来源站为 ega-archive.org，源站记录年份为 2024 年。
【数据集背景】
肌萎缩侧索硬化是一种累及神经系统的疾病，其分子层面的改变是相关研究关注的重点。前额叶皮层作为脑组织的重要组成部分，其转录组特征能够反映基因表达层面的状态差异。该数据集以人前额叶皮层组织为材料，设置 ALS 与 CTR 两组，为在组织水平上比较患者与对照的转录组差异提供了数据基础，服务于 ALS 相关分子机制与生物标志物方向的研究需求。
【数据内容】
该数据集提供人前额叶皮层组织的转录组数据，样本按肌萎缩侧索硬化（ALS）与对照（CTR）分组。数据覆盖 ALS 患者与对照人群的前额叶皮层样本，核心用途在于比较两组间的基因表达差异。除上述分组与组织类型、数据类型的说明外，源站未提供关于样本数量、测序平台、表达定量指标、基因注释版本等更细粒度的信息。
【采集与来源】
数据集来源于 EGA 归档，来源站为 ega-archive.org，源站数据集页面为 https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000000467，源站描述中的记录年份为 2024 年。数据取材于人的前额叶皮层组织，并按 ALS 与 CTR 进行分组。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体机构信息，源站未提供。
【适用场景】
依据该数据集的分组设计与组织类型，其适用场景包括：比较 ALS 患者与对照人群前额叶皮层样本之间的基因表达差异；支持 ALS 相关分子机制的探索；用于候选生物标志物的筛选研究；以及基于转录组特征开展分类建模等研究。上述场景均围绕 ALS 与对照两组间的转录组比较展开。
【使用方法】
使用该数据集时，可按照 ALS 与 CTR 的分组对前额叶皮层转录组数据进行组间比较，识别差异表达的基因，并在此基础上开展机制分析、候选标志物筛选或分类建模。由于源站未提供样本量、平台与定量方法等细节，具体分析流程中的预处理、标准化与统计方法需依据数据实际内容确定，源站未提供相关说明。
【质量与限制】
该数据集来自 EGA 归档，属于公开登记的数据集条目，其分组信息明确为 ALS 与 CTR。限制方面，源站未提供样本数量、测序深度、数据完整性评估、批次信息及质量控制指标等内容，也未提供主题标签；因此在使用前需自行核实数据的具体构成与适用范围。此外，该数据集仅涉及前额叶皮层组织，源站未提供其他脑区或组织的相关信息。
【引用与许可】
引用该数据集时，可参照源站描述格式：Transcriptomics dataset from human prefrontal cortex tissue - ALS vs CTR [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000000467，记录年份为 2024 年。关于数据使用的许可条款与访问权限要求，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000000467
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
(2024). Transcriptomics dataset from human prefrontal cortex tissue - ALS vs CTR [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000000467
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
