PubMed摘要中与ALS最常共同提及的50种疾病
该数据集来自plos.figshare.com，收录了PubMed摘要中与肌萎缩侧索硬化（ALS）最常共同提及的50种疾病
基本信息
资源简介
PubMed摘要中与ALS最常共同提及的50种疾病
Top 50 diseases most commonly co-mentioned with ALS in PubMed abstracts.
该数据集来自plos.figshare.com，收录了PubMed摘要中与肌萎缩侧索硬化（ALS）最常共同提及的50种疾病。每条记录包含疾病本体ID、缩写、疾病名称、提及该病的PubMed摘要数、与ALS共同提及的摘要数、过表达比率、超几何检验P值及人工疾病类型分类。数据可用于分析ALS与其他疾病的文献共现模式、评估疾病关联强度，并支持基于疾病本体结构的分类研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2022-05-16。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：科学文献中与ALS最常共同提及的50种疾病列表。疾病已依据Disease Ontology的树结构手动分类为“疾病类型”[32, 33]。ID：Disease Ontology ID。Abbreviation：图5–9中使用的疾病简称。Name：Disease Ontology中的疾病名称。Occurences：提及该疾病的PubMed摘要数。Co-mentionings：同时提及该疾病与ALS的PubMed摘要数。Overrep. ratio：共提及的过表达比率。P-value：疾病与ALS重叠的超几何检验显著性。Disease type：疾病的人工分类。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 17.92 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0268159.t003。
【主题与分类】
源站学科分类：Biophysics、Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。主题标签：publicly available databases、parkinson &# 8217、huntington &# 8217、avoid bias caused、amyotrophic lateral sclerosis、alzheimer &# 8217、also allow us、enriched modules cover、core modules highlights、core modules enriched。本站分类：神经系统疾病/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Top_50_diseases_most_commonly_co-mentioned_with_ALS_in_PubMed_abstracts_/19774134
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Jensen, Klaus Højgaard; Stalder, Anna Katharina; Wernersson, Rasmus; Roloff-Handschin, Tim-Christoph; Hansen, Daniel Hvidberg; Groenen, Peter M. A. (2022). Top 50 diseases most commonly co-mentioned with ALS in PubMed abstracts.. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-05，引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Top 50 diseases most commonly co-mentioned with ALS in PubMed abstracts.
- DOI：10.1371/journal.pone.0268159.t003
- 发布日期：2022-05-16
- 文件数：1 个
- 文件总体积：17.92 KB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Top_50_diseases_most_commonly_co-mentioned_with_ALS_in_PubMed_abstracts_/19774134
命令行下载
curl -L -o "Table 3.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/35132412"
文件清单
Table 3.xls（17.92 KB）
文件总体积 17.92 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
与ALS在科学文献中最常共同提及的50种疾病列表。疾病已根据疾病本体论[32, 33]中的树状结构手动分类为“疾病类型”。ID：疾病本体论ID。缩写：图5-9中使用的疾病简称。名称：疾病本体论中的疾病名称。出现次数：提及该疾病的PubMed摘要数量。共同提及次数：同时提及该疾病和ALS的PubMed摘要数量。超代表比率：共同提及的超代表比率。P值：疾病与ALS重叠的超几何检验显著性。疾病类型：疾病的手动分类。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0268159.t003（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Top_50_diseases_most_commonly_co-mentioned_with_ALS_in_PubMed_abstracts_/19774134）。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
