PXD000657:脑脊液蛋白质组图谱:人血浆LC-MS/MS,第7部分

该数据集来自EBI,属于神经系统疾病/其他分类,为脑脊液蛋白质组图谱项目的一部分。实验取20名神经学健康供者混合血浆40 µL,经MARS Hu-14柱分离为结合与耗竭组分,本数据集为耗竭组分

pride
2014-08-04 更新
浏览 8
蛋白质预测PlasmaHomo sapiensLc-ms/ms
PXD000657: CSF proteome mapping: Human plasma LC-MS/MS, Part 7

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2014-08-04

资源简介

PXD000657:脑脊液蛋白质组图谱:人血浆LC-MS/MS,第7部分

该数据集来自EBI,属于神经系统疾病/其他分类,为脑脊液蛋白质组图谱项目的一部分。实验取20名神经学健康供者混合血浆40 µL,经MARS Hu-14柱分离为结合与耗竭组分,本数据集为耗竭组分。样本经溶液内胰蛋白酶消化,用Promix MP柱以混合模式反相阴离子交换分馏为67个组分,各组分在Orbitrap Velos Pro质谱仪上分别进行LC-MS/MS分析。数据经SearchGui搜索、PeptideShaker汇总并导出至CSF-PR。可用于血浆蛋白质组鉴定与神经系统疾病相关生物标志物研究(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):取20名神经学健康供者混合血浆40 µL,使用MARS Hu-14柱分离为结合组分和耗竭组分。本实验代表耗竭组分。样本经溶液内胰蛋白酶消化,肽段通过混合模式反相阴离子交换(MM(RP-AX))使用Promix MP柱分馏为67个组分。每个组分在Orbitrap Velos Pro质谱仪上分别通过LC-MS/MS分析。所得数据使用SeachGui搜索,在PeptideShaker中汇总并导出至CSF-PR。

【主题与分类】

主题标签:Plasma、Homo sapiens、Lc-ms/ms。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000657

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

将来自20名神经系统健康供体混合血浆的40 µL样本,使用MARS Hu-14柱分离为结合组分和耗竭组分。本实验代表耗竭组分。样品经溶液内胰蛋白酶消化后,使用Promix MP柱通过混合模式反相阴离子交换(MM(RP-AX))将肽段分级为67个组分。每个组分均在Orbitrap Velos Pro质谱仪上通过LC-MS/MS单独分析。所得数据使用SeachGui搜索,在PeptideShaker中汇总,并导出至CSF-PR。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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