PRJNA961117:神经细胞外基质调控视觉感觉运动整合

该数据集来自 NCBI,主题为神经细胞外基质对视觉感觉运动整合的调控。研究以四种细胞外基质成分(brevican、neurocan、tenascin-C、tenascin-R)四重敲除小鼠为对象,发现其导致严重视网膜功能障碍和体内视觉运动处理减弱,并伴随胆碱能方向选择性星爆无长突细胞的发育性丢失,以

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时间序列分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA961117: Neural extracellular matrix regulates visual sensory motor integration

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

PRJNA961117:神经细胞外基质调控视觉感觉运动整合

该数据集来自 NCBI,主题为神经细胞外基质对视觉感觉运动整合的调控。研究以四种细胞外基质成分(brevican、neurocan、tenascin-C、tenascin-R)四重敲除小鼠为对象,发现其导致严重视网膜功能障碍和体内视觉运动处理减弱,并伴随胆碱能方向选择性星爆无长突细胞的发育性丢失,以及视网膜抑制性与兴奋性突触信号失衡。数据主题标签为转录组或基因表达,可用于研究细胞外基质蛋白在视网膜功能与视觉运动处理中的作用(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):视觉处理依赖于敏感且平衡的突触神经传递。细胞环境中的细胞外基质蛋白是突触形成和突触可塑性的关键调节因子。在本研究中,我们提供证据表明,四种细胞外基质成分brevican、neurocan、tenascin-C和tenascin-R在四重敲除小鼠中的联合缺失会导致严重的视网膜功能障碍和体内视觉运动处理减弱。值得注意的是,视觉运动处理受损伴随着胆碱能方向选择性星爆无长突细胞的发育性丢失。此外,我们注意到四重敲除视网膜中抑制性与兴奋性突触信号失衡。总体而言,该研究为四种关键细胞外基质蛋白在视网膜功能、视觉运动处理及s

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA961117

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

视觉处理依赖于敏感且平衡的突触神经传递。细胞环境中的细胞外基质蛋白是突触形成和突触可塑性的关键调节因子。在本研究中,我们提供证据表明,四重敲除小鼠中四种细胞外基质成分——短蛋白聚糖、神经聚糖、腱生蛋白-C和腱生蛋白-R的联合缺失,导致严重的视网膜功能障碍和体内视觉运动处理能力下降。值得注意的是,视觉运动处理受损伴随着胆碱能方向选择性星爆无长突细胞的发育性丢失。此外,我们注意到四重敲除视网膜中抑制性和兴奋性突触信号传导的失衡。总体而言,该研究为四种关键细胞外基质蛋白在视网膜功能、视觉运动处理和突触信号传导中的功能重要性提供了新的见解。总体设计:我们的数据集包括从成年解剖的Bcan、Ncan、Tnc和Tnr(四重)敲除小鼠及野生型小鼠视网膜中获得的表达数据。总共分析了来自4只对照野生型小鼠和4只四重敲除小鼠的8个视网膜样本。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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